More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1759 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 217 aa  444  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  75.12 
 
 		 222 aa  347  7e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 217 aa  218  5e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 217 aa  218  5e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  51.9 
 
 		 217 aa  217  7.999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  51.43 
 
 		 217 aa  216  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 217 aa  215  5e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  50.95 
 
 		 217 aa  214  9e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  50.95 
 
 		 217 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  50.95 
 
 		 217 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  50.48 
 
 		 217 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  50.48 
 
 		 217 aa  210  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0022  transcriptional regulator, TetR family  47.71 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0736  transcriptional regulator  34.32 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0112088  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0016  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 216 aa  95.5  6e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  42.28 
 
 		 205 aa  90.1  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0258  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.569121  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  26.18 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  41.24 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 195 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  65.31 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 196 aa  62  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  52 
 
 		 206 aa  62  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0599  TetR family transcriptional regulator  55.1 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000153581  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2741  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  49.06 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  24.49 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2735  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0212  transcription regulator TetR/AcrR family protein  43.18 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0180  TetR/AcrR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0296493  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0183  TetR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 307 aa  58.5  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 244 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  23.22 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23280  transcriptional regulator, TetR family  26.21 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3071  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0385264  normal  0.592961 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0986  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  52 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  25.57 
 
 		 255 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  26.59 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 243 aa  57  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  25.42 
 
 		 236 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2369  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  26.59 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0194  TetR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  59.18 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  35.8 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2181  transcriptional regulator, TetR family  30.08 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000940073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>