More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1920 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1920  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  443  1.0000000000000001e-124  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2103  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 239 aa  175  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4449  TetR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2785  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256269 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  28.09 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  26.82 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  23.93 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  26.7 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2189  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3340  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  25.73 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3449  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04680  transcriptional regulator  21.95 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5471  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5463  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000220885  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5024  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5518  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.142065  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5189  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5138  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5040  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5585  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5433  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.944120000000001e-18 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  25 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  25.32 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  29.37 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5489  transcriptional regulator, TetR family  27.95 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.152228  hitchhiker  8.2338e-23 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0778  transcriptional regulator BetI  36.44 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3861  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2271  transcriptional regulator  26.63 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  24.7 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  23.86 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  32.42 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  24.16 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4758  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.939945 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2925  regulatory protein TetR  22.22 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  24.19 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0235  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0891  transcriptional regulator BetI  31.01 
 
 		 208 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21263  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4009  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  26.78 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3999  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 231 aa  52.8  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  25.34 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1747  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2310  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  decreased coverage  0.00710043 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5303  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444335 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  31.1 
 
 		 224 aa  52.8  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 218 aa  52.4  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 204 aa  52  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1135  putative transcriptional regulator  27.89 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  22.87 
 
 		 242 aa  52.4  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 197 aa  52  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0914  transcriptional regulatory protein  25 
 
 		 210 aa  51.6  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.626019  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  22.22 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1380  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000685689  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  22.75 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 195 aa  50.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3465  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  26.62 
 
 		 194 aa  50.1  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12440  AcrR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 273 aa  49.3  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 		 190 aa  49.3  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 203 aa  49.7  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 238 aa  49.3  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5445  TetR family transcriptional regulator  22.11 
 
 		 225 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5417  TetR family transcriptional regulator  22.11 
 
 		 225 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.618934  decreased coverage  0.00324744 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 224 aa  48.9  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 223 aa  48.9  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 228 aa  48.9  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  25.32 
 
 		 183 aa  48.5  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 470 aa  48.5  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  25.48 
 
 		 204 aa  48.5  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  24.88 
 
 		 202 aa  48.5  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3862  regulatory protein, TetR  21.66 
 
 		 202 aa  48.5  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.07928  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3182  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 216 aa  48.1  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.86361 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 214 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>