More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2162 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 209 aa  429  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0835  TetR family transcriptional regulator  62.89 
 
 		 201 aa  248  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2271  transcriptional regulator  64.77 
 
 		 209 aa  248  3e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2996  TetR family transcriptional regulator  61.14 
 
 		 193 aa  241  7e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.542374  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0402  TetR family transcriptional regulator  61.98 
 
 		 196 aa  235  4e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.498778  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  62.37 
 
 		 206 aa  234  9e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  59.79 
 
 		 194 aa  231  7.000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  50.53 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2310  TetR family transcriptional regulator  48.95 
 
 		 220 aa  169  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  decreased coverage  0.00710043 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 234 aa  164  6.9999999999999995e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 212 aa  145  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2785  TetR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 196 aa  145  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256269 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 201 aa  114  6.9999999999999995e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 202 aa  104  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 202 aa  94.7  8e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  28.8 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  26.11 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2216  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191802  normal  0.0189795 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  31.46 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_2063  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 208 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  32.97 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014165  Tbis_2869  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013441  Gbro_4520  regulatory protein TetR  31.58 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3862  regulatory protein, TetR  29.76 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.07928  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1684  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.828148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 232 aa  72  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1851  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.144681  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  27.51 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 251 aa  68.6  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1071  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1833  regulatory protein, TetR  27.84 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  30.13 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3368  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.823068  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4794  transcriptional regulator, TetR family  31.66 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 224 aa  62  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 224 aa  62  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 208 aa  62  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0894  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 260 aa  62  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  23.43 
 
 		 224 aa  62  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  23.32 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3897  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2103  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2147  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576982  hitchhiker  0.00198138 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3566  regulatory protein TetR  28.38 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2591  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.266738 
 
 
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NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_3240  putative transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00194759  normal  0.442697 
 
 
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NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
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NC_008699  Noca_0817  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577348  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
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NC_010501  PputW619_2194  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.789913  normal  1 
 
 
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NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  21.93 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
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NC_009512  Pput_2007  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
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