More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3566 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3566  regulatory protein TetR  100 
 
 
205 aa  411  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  37.7 
 
 
211 aa  127  9.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3999  transcriptional regulator, TetR family  41.24 
 
 
207 aa  117  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1851  transcriptional regulator, TetR family  40.64 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.144681  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  36.84 
 
 
196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0817  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
210 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577348  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0836  transcriptional regulator, TetR family  38.32 
 
 
203 aa  103  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.177404  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4009  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 
217 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3862  regulatory protein, TetR  36.53 
 
 
202 aa  92.4  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.07928  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1833  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 
236 aa  90.5  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2869  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 
285 aa  79.7  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 
223 aa  78.6  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2310  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
220 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  decreased coverage  0.00710043 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 
232 aa  74.7  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 
212 aa  74.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 
201 aa  68.9  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  24.44 
 
 
220 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  26.6 
 
 
202 aa  67  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 
235 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2271  transcriptional regulator  27.32 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 
251 aa  65.1  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 
218 aa  63.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 
209 aa  63.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0452  regulatory protein TetR  27.84 
 
 
221 aa  64.3  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 
202 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 
234 aa  60.1  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  29.88 
 
 
200 aa  60.1  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 
214 aa  59.3  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 
200 aa  59.3  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  32.35 
 
 
208 aa  57.4  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4520  regulatory protein TetR  27.7 
 
 
228 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3756  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 
193 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
201 aa  56.2  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 
243 aa  56.2  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0835  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 
201 aa  55.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  26.72 
 
 
196 aa  55.8  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2785  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
196 aa  55.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.256269 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2996  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 
193 aa  55.5  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.542374  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0170  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 
233 aa  55.5  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000323068 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2007  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
193 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 
231 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 
208 aa  54.7  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 
208 aa  54.3  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 
214 aa  53.9  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 
194 aa  54.7  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2147  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
193 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576982  hitchhiker  0.00198138 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 
190 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 
241 aa  53.1  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 
202 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 
246 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1684  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 
228 aa  52.8  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.828148  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0096  transcriptional regulator, TetR family  24.83 
 
 
196 aa  52.4  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  25.89 
 
 
202 aa  52.8  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  25.54 
 
 
211 aa  52.8  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3897  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
213 aa  52.4  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 
228 aa  52.4  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  26.45 
 
 
220 aa  52  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 
181 aa  52  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
227 aa  52  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  26.23 
 
 
213 aa  52  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 
217 aa  52  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0402  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 
196 aa  51.6  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.498778  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  25.47 
 
 
225 aa  52  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  26.12 
 
 
195 aa  51.6  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 
226 aa  51.6  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 
206 aa  52  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  24.19 
 
 
190 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5473  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 
201 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.0284284 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
211 aa  51.6  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0991  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 
190 aa  51.2  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 
227 aa  51.6  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1237  transcriptional regulator, TetR family  24.18 
 
 
190 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1159  transcriptional regulator, TetR family  24.18 
 
 
190 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 
200 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 
235 aa  50.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 
310 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7595  transcriptional regulator TetR family  27.04 
 
 
223 aa  51.2  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 
200 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1548  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 
223 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  24.89 
 
 
231 aa  50.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2194  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 
193 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.789913  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 
195 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 
195 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 
222 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 
197 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02663  transcriptional regulator  26.44 
 
 
204 aa  50.1  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806616  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 
195 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 
210 aa  50.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3745  transcriptional regulator, TetR family  25.49 
 
 
201 aa  49.7  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 
195 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 
195 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  25.14 
 
 
195 aa  50.1  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  25.14 
 
 
195 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
332 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
233 aa  49.7  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 
198 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 
183 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 
194 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  22.73 
 
 
260 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>