More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2216 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2216  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 189 aa  389  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191802  normal  0.0189795 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2241  TetR family transcriptional regulator  65.5 
 
 		 198 aa  225  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7288  hitchhiker  0.000000000000408452 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 228 aa  92  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  24.08 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  24.04 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 220 aa  74.7  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2310  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  decreased coverage  0.00710043 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  28.8 
 
 		 200 aa  71.2  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  26.02 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 238 aa  65.1  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  24.72 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2271  transcriptional regulator  24.73 
 
 		 209 aa  62  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0243  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0226  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312291  hitchhiker  0.00018932 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 		 205 aa  61.2  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 228 aa  61.2  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0304  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.826155  hitchhiker  0.000375508 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  23.96 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2782  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.522237  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0324  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0252  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323074 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  21.39 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3248  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1950  TetR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3423  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1909  transcriptional regulator, TetR family  23.12 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2785  TetR family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256269 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_003296  RS03754  transcription regulator protein  24.19 
 
 		 215 aa  57.8  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.727658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  20.54 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  23.89 
 
 		 213 aa  57.8  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  24.6 
 
 		 229 aa  57.8  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3490  transcriptional regulator, TetR family  24.19 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4562  transcriptional regulator, TetR family  24.19 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.602927 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  21.08 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1819  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191224 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0186  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3368  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 229 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.823068  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0835  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0289  TetR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  22.87 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0935  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3324  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4789  transcriptional regulator  24.85 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0280  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.980178  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3668  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0040426  hitchhiker  0.0000000599644 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  20.32 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2996  TetR family transcriptional regulator  20.21 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.542374  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0349  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0474  transcriptional regulator, TetR family  25.83 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.542957  hitchhiker  4.20035e-18 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0294  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136884  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  23.43 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4787  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0422575  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4482  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  19.79 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  25.67 
 
 		 260 aa  54.7  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  22.29 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0402  TetR family transcriptional regulator  22.53 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.498778  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4551  transcriptional regulator, N-terminus  38.1 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4396  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  23.83 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2863  TetR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603343 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0894  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 260 aa  54.3  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>