278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1833 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1833  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 236 aa  475  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  44.5 
 
 		 211 aa  157  9e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3862  regulatory protein, TetR  40.96 
 
 		 202 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.07928  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  38.46 
 
 		 196 aa  121  8e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3999  transcriptional regulator, TetR family  39.9 
 
 		 207 aa  112  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4009  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0836  transcriptional regulator, TetR family  36.98 
 
 		 203 aa  109  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.177404  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1851  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 201 aa  99.4  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.144681  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0817  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 210 aa  97.4  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577348  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 232 aa  95.1  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  33.52 
 
 		 202 aa  94.4  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3566  regulatory protein TetR  33.15 
 
 		 205 aa  89.4  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2869  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  30.27 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0452  regulatory protein TetR  30.53 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2310  TetR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  decreased coverage  0.00710043 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2785  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256269 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0402  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.498778  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  22.87 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0835  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  24.61 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  24.61 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  25.73 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2996  TetR family transcriptional regulator  21.64 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.542374  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  25.98 
 
 		 287 aa  54.7  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  25.63 
 
 		 211 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4520  regulatory protein TetR  27.56 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2271  transcriptional regulator  22.7 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4199  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 290 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 223 aa  53.5  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  28.68 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 215 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  21.39 
 
 		 207 aa  52.4  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 205 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 205 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  32.37 
 
 		 278 aa  52.4  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 408 aa  52  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2515  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 202 aa  51.6  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17960  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 208 aa  51.6  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 246 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 183 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1909  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  24.29 
 
 		 194 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5045  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 214 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 208 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  26.36 
 
 		 197 aa  50.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1468  transcriptional regulator, TetR family  23.46 
 
 		 190 aa  50.1  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2452  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 228 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2063  transcriptional regulator, TetR family  26.78 
 
 		 208 aa  49.3  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0322  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 223 aa  48.9  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.541277 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 		 213 aa  48.9  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  25.77 
 
 		 198 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 212 aa  48.9  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0891  transcriptional regulator BetI  32.63 
 
 		 208 aa  48.5  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21263  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 209 aa  48.5  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 202 aa  48.5  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  22.51 
 
 		 229 aa  48.5  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0652  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00127288  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  23.91 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  25.4 
 
 		 184 aa  48.5  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1473  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 187 aa  48.1  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>