More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1851 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1851  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 201 aa  400  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.144681  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  52.28 
 
 		 196 aa  195  4.0000000000000005e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3862  regulatory protein, TetR  50.76 
 
 		 202 aa  177  8e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.07928  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  46.15 
 
 		 211 aa  160  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0817  TetR family transcriptional regulator  45.55 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577348  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3999  transcriptional regulator, TetR family  46.86 
 
 		 207 aa  129  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3566  regulatory protein TetR  41.28 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4009  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 		 217 aa  111  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1833  regulatory protein, TetR  36.11 
 
 		 236 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0836  transcriptional regulator, TetR family  41.76 
 
 		 203 aa  106  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.177404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  38.02 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 202 aa  95.5  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 201 aa  95.1  7e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2869  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 285 aa  92.4  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  32.8 
 
 		 202 aa  91.7  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  26.46 
 
 		 207 aa  87.4  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 228 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0835  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 201 aa  86.3  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 200 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 200 aa  85.5  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 256 aa  84.7  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  26.97 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 238 aa  81.6  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2063  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 244 aa  78.6  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 260 aa  78.2  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2996  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 193 aa  78.2  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.542374  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0402  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.498778  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  23.24 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2785  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256269 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0452  regulatory protein TetR  30.41 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  26.18 
 
 		 214 aa  71.2  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 241 aa  68.6  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4520  regulatory protein TetR  29.89 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 224 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  22.94 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 240 aa  67  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 192 aa  67  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  28.08 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  24.59 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  29.53 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_5473  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.0284284 
 
 
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NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  25.67 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
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NC_009952  Dshi_2271  transcriptional regulator  28.21 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.850012 
 
 
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NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
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NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 770 aa  64.7  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  28.06 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
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NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  24.49 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
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