More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0170 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 201 aa  401  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  71.13 
 
 		 200 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  68.88 
 
 		 200 aa  279  2e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  68.18 
 
 		 211 aa  275  4e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3870  transcriptional regulator, TetR family  66 
 
 		 208 aa  266  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0541518  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25250  transcriptional regulator  44.67 
 
 		 190 aa  154  8e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.862967  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0566  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 207 aa  122  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0703  transcriptional regulator, TetR family  37.69 
 
 		 216 aa  121  8e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3240  putative transcriptional regulator, TetR family  35.68 
 
 		 201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00194759  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 219 aa  95.9  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2346  hypothetical protein  30.61 
 
 		 217 aa  92.4  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  36.42 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3256  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.757999  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2306  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3481  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 189 aa  62  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148181  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 212 aa  61.2  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0026  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.348467  normal  0.209562 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3892  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3190  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000548437  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3878  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3966  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 235 aa  57  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  30.56 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2195  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4172  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6467  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1904  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.550528  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  42.86 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2069  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  25.19 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2515  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01891  transcription regulator protein  42.42 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139537  normal  0.638618 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4085  putative transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 237 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3562  TetR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 241 aa  54.7  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 		 223 aa  53.9  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1743  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 388 aa  53.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6653  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.713495  normal  0.0271875 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1173  TetR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3647  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  28.9 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0126984  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03806  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 237 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 250 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 280 aa  53.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 219 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1480  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 235 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1502  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 235 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1851  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.144681  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  24.05 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0884  transcriptional regulator, TetR family  25.56 
 
 		 193 aa  52.8  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0708225  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  30.11 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0610  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 189 aa  52.8  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.442155  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  26.62 
 
 		 193 aa  52.8  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 257 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  23.91 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1086  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 219 aa  52.4  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.535417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 229 aa  52.4  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0561  transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 193 aa  52.8  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 207 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 218 aa  52  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 324 aa  52.4  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  48.98 
 
 		 219 aa  52.4  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>