More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3999 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3999  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 207 aa  408  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  52.04 
 
 		 211 aa  194  8.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4009  transcriptional regulator, TetR family  46.73 
 
 		 217 aa  163  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0836  transcriptional regulator, TetR family  49.23 
 
 		 203 aa  156  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.177404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  44.2 
 
 		 196 aa  149  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0817  TetR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577348  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3862  regulatory protein, TetR  50.8 
 
 		 202 aa  145  5e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.07928  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1833  regulatory protein, TetR  39.79 
 
 		 236 aa  132  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1851  transcriptional regulator, TetR family  47.25 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.144681  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3566  regulatory protein TetR  41.71 
 
 		 205 aa  124  8.000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  38.41 
 
 		 223 aa  99.4  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  35.91 
 
 		 232 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2785  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 196 aa  89  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256269 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 251 aa  87  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  35.48 
 
 		 202 aa  87  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 234 aa  86.7  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2869  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 285 aa  82  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 202 aa  71.2  0.000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  33.18 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2271  transcriptional regulator  28.76 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0835  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3562  TetR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 246 aa  68.2  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0402  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.498778  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2846  regulatory protein, TetR  32.45 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 220 aa  64.7  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0452  regulatory protein TetR  33 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  28.12 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2996  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.542374  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 335 aa  62.8  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 188 aa  62  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2310  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  decreased coverage  0.00710043 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5045  TetR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  25.64 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3765  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0357958 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  40.19 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6780  TetR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.188016 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 255 aa  58.2  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5471  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3179  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  25.62 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  35.14 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  33.06 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  26.25 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5518  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.142065  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2063  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  25.17 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17960  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 287 aa  55.1  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5463  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000220885  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3827  putative transcriptional regulator  31.39 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1684  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.828148  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5189  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5040  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5585  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5433  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.944120000000001e-18 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44980  TetR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5024  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1920  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 213 aa  53.9  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1806  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.382485 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  36.19 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  24.48 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3861  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>