More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5473 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5473  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  410  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.0284284 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  91.04 
 
 		 200 aa  374  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1520  transcriptional regulator, TetR family  64.8 
 
 		 208 aa  248  6e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431113 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1801  transcriptional regulator, TetR family  62.24 
 
 		 207 aa  240  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882167  normal  0.119004 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1522  regulatory protein TetR  62.24 
 
 		 207 aa  240  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.485337 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2750  TetR family transcriptional regulator  56.92 
 
 		 205 aa  223  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172363  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4377  transcriptional regulator, TetR family  56.41 
 
 		 205 aa  221  7e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314155  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2216  TetR family transcriptional regulator  55.38 
 
 		 203 aa  208  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0817319 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1755  TetR family transcriptional regulator  59.16 
 
 		 209 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4072  TetR family transcriptional regulator  50.26 
 
 		 204 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1358  TetR family transcriptional regulator  54.1 
 
 		 211 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.824963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4900  transcriptional regulator, TetR family  51.56 
 
 		 204 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4220  TetR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 204 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.267151 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0096  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 196 aa  184  8e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1083  TetR family transcriptional regulator  51.58 
 
 		 203 aa  181  7e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.243709  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3745  transcriptional regulator, TetR family  43.62 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3471  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 202 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3759  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 		 202 aa  141  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.341264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3772  TetR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 201 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.392718  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2825  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 204 aa  125  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1000  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 202 aa  102  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1344  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000662672 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3141  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 204 aa  99.4  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 196 aa  99  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3548  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 207 aa  98.6  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842454  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3207  putative transcription regulator protein  33.13 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00713158  normal  0.0476395 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2192  regulatory protein, TetR  31.61 
 
 		 204 aa  94.7  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0820152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3444  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 205 aa  94  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349562  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0822  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 205 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.752802  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1642  regulatory protein TetR  33.93 
 
 		 243 aa  92  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.906249  normal  0.298485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1924  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 243 aa  92  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.436993 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1588  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 243 aa  91.7  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6030  transcriptional regulator TetR family  33.53 
 
 		 222 aa  91.3  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1872  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  91.3  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3300  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2425  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 204 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal  0.599881 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3603  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 205 aa  90.1  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162578  normal  0.242533 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0939  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 205 aa  89.7  3e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3154  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 200 aa  88.6  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3444  transcriptional regulator, TetR family  35.12 
 
 		 200 aa  89  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1297  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 205 aa  88.2  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.843552  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6533  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 205 aa  88.2  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6140  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 205 aa  88.2  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.943652 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6291  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 205 aa  88.2  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170422  normal  0.0225355 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5351  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 195 aa  87.8  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124857 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5361  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296046  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2679  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 204 aa  87  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2481  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6577  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 205 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0918  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 191 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.141078 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1464  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3319  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 205 aa  85.9  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1558  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 204 aa  85.9  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.231141  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1507  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 224 aa  84.7  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0289697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5814  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 195 aa  84.7  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5655  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0301112  normal  0.0166104 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 194 aa  84.3  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6237  transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.250294  normal  0.446462 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5641  regulatory protein, TetR  32.32 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1122  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 242 aa  81.3  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0273535  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5104  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46570  putative transcriptional regulator  29.34 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161907  hitchhiker  0.00000116969 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2160  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.308493 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2324  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0513  transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.826847 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3517  trancscriptional regulator MtrR, putative  22.62 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178393  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 204 aa  62  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1420  hypothetical protein  38.55 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57852  normal  0.215319 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0829  transcriptional regulator, TetR family  23.94 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  29.86 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  39.78 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3360  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.372466  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
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NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
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NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011886  Achl_0724  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
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NC_008786  Veis_1789  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.484582  normal  1 
 
 
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NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  25.52 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013132  Cpin_0612  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
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NC_011989  Avi_1313  transcriptional regulator TetR family  25.4 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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