More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2825 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2825  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 204 aa  415  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4220  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 204 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.267151 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3772  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 201 aa  131  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.392718  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4377  transcriptional regulator, TetR family  40.59 
 
 		 205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314155  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3471  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 202 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5473  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 201 aa  125  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.0284284 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3759  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 202 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.341264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  40.11 
 
 		 200 aa  123  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1358  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.824963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2750  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 205 aa  122  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172363  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0096  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 196 aa  118  7e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2216  TetR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0817319 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4900  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 204 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1522  regulatory protein TetR  39.64 
 
 		 207 aa  116  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.485337 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1801  transcriptional regulator, TetR family  39.64 
 
 		 207 aa  116  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882167  normal  0.119004 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4072  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 204 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1520  transcriptional regulator, TetR family  36.65 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431113 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1083  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 203 aa  112  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.243709  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3548  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 207 aa  99  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3444  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 205 aa  98.2  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3745  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 201 aa  95.5  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6577  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 205 aa  95.1  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3207  putative transcription regulator protein  32.58 
 
 		 204 aa  94.4  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00713158  normal  0.0476395 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6140  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 205 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.943652 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1297  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 205 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.843552  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6533  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 205 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6291  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 205 aa  94  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170422  normal  0.0225355 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0939  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 205 aa  93.2  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1000  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 202 aa  93.2  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1755  TetR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 209 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5655  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 205 aa  92.4  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0301112  normal  0.0166104 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3444  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 200 aa  90.9  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3154  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 200 aa  89.4  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2425  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 204 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal  0.599881 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5361  transcriptional regulator, TetR family  32.87 
 
 		 205 aa  86.3  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296046  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3319  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 205 aa  85.5  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2192  regulatory protein, TetR  29.34 
 
 		 204 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0820152  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3300  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 204 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5814  transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 		 195 aa  85.1  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6030  transcriptional regulator TetR family  31.74 
 
 		 222 aa  84.7  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0822  transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.752802  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5104  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1872  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2679  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2481  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1507  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0289697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3141  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1558  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.231141  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1464  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1924  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.436993 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46570  putative transcriptional regulator  27.01 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161907  hitchhiker  0.00000116969 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1642  regulatory protein TetR  32.14 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.906249  normal  0.298485 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1588  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 243 aa  74.7  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3603  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162578  normal  0.242533 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0918  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.141078 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1590  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  26.35 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6237  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.250294  normal  0.446462 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5351  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 195 aa  71.2  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124857 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5641  regulatory protein, TetR  25.61 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1122  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 242 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0273535  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  45.95 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2160  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.308493 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0513  transcriptional regulator, TetR family  23.24 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.826847 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  24.4 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0359  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.717722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1344  TetR family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000662672 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3517  trancscriptional regulator MtrR, putative  22.09 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178393  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  26.96 
 
 		 229 aa  58.2  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  38.83 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  24.56 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  28.93 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 408 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
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NC_013131  Caci_2324  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  27.38 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
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NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
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NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
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NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
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NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
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NC_011886  Achl_0724  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
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NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_1156  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 227 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 390 aa  52.8  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 229 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
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NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 216 aa  52.4  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
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NC_007493  RSP_2853  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 213 aa  52  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.788684  n/a   
 
 
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