More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5104 on replicon NC_010335
Organism: Caulobacter sp. K31



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010335  Caul_5104  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
205 aa  427  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2481  TetR family transcriptional regulator  56.31 
 
 
206 aa  235  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6291  TetR family transcriptional regulator  56.35 
 
 
205 aa  231  6e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170422  normal  0.0225355 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6577  TetR family transcriptional regulator  56.35 
 
 
205 aa  230  9e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6140  TetR family transcriptional regulator  56.35 
 
 
205 aa  228  7e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.943652 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1297  TetR family transcriptional regulator  56.35 
 
 
205 aa  228  7e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.843552  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6533  TetR family transcriptional regulator  56.35 
 
 
205 aa  228  7e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2192  regulatory protein, TetR  54.4 
 
 
204 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0820152  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5361  transcriptional regulator, TetR family  53.17 
 
 
205 aa  217  7e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296046  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0939  TetR family transcriptional regulator  53.17 
 
 
205 aa  217  7.999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5655  TetR family transcriptional regulator  54.4 
 
 
205 aa  215  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0301112  normal  0.0166104 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2679  transcriptional regulator, TetR family  54.4 
 
 
204 aa  210  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3444  TetR family transcriptional regulator  53.65 
 
 
205 aa  208  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349562  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3548  TetR family transcriptional regulator  55.43 
 
 
207 aa  208  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842454  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0822  transcriptional regulator, TetR family  52.08 
 
 
205 aa  208  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.752802  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3319  transcriptional regulator, TetR family  52.6 
 
 
205 aa  205  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3207  putative transcription regulator protein  54.14 
 
 
204 aa  201  6e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00713158  normal  0.0476395 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2425  TetR family transcriptional regulator  50.26 
 
 
204 aa  201  9e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal  0.599881 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3300  TetR family transcriptional regulator  51.28 
 
 
204 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1558  transcriptional regulator, TetR family  53.63 
 
 
204 aa  198  5e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.231141  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1872  TetR family transcriptional regulator  51.81 
 
 
204 aa  196  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46570  putative transcriptional regulator  53.55 
 
 
205 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161907  hitchhiker  0.00000116969 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5641  regulatory protein, TetR  55.96 
 
 
205 aa  194  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3141  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 
204 aa  189  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1000  transcriptional regulator, TetR family  47.67 
 
 
202 aa  187  5.999999999999999e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6237  transcriptional regulator, TetR family  44.79 
 
 
204 aa  184  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.250294  normal  0.446462 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1358  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 
211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.824963  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1083  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
203 aa  103  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.243709  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3759  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 
202 aa  99.4  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.341264  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4220  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 
204 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.267151 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4900  transcriptional regulator, TetR family  33.57 
 
 
204 aa  95.1  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3471  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 
202 aa  94.7  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4072  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 
204 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404237  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2216  TetR family transcriptional regulator  34.06 
 
 
203 aa  92  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0817319 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5473  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
201 aa  87  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.0284284 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4377  transcriptional regulator, TetR family  26.84 
 
 
205 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314155  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2825  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
204 aa  82.8  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 
200 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3772  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
201 aa  77.8  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.392718  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0096  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 
196 aa  76.6  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1522  regulatory protein TetR  32.82 
 
 
207 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.485337 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1801  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 
207 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882167  normal  0.119004 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1520  transcriptional regulator, TetR family  29.58 
 
 
208 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.431113 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2750  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 
205 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172363  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3745  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 
201 aa  68.2  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1344  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
208 aa  62  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000662672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5814  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 
195 aa  59.3  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1507  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 
224 aa  57.4  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0289697  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 
190 aa  56.6  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3517  trancscriptional regulator MtrR, putative  24.46 
 
 
197 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178393  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0940  transcriptional regulator  29.25 
 
 
210 aa  56.2  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00130273  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3625  regulatory protein TetR  48.15 
 
 
191 aa  55.8  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2636  TetR family transcriptional regulator  45.07 
 
 
205 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132236  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4517  TetR family transcriptional regulator  45.07 
 
 
205 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000667757  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
190 aa  55.5  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1755  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
209 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 
196 aa  55.1  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3444  transcriptional regulator, TetR family  24.7 
 
 
200 aa  54.7  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3154  transcriptional regulator, TetR family  24.39 
 
 
200 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 
202 aa  54.3  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
182 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
202 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 
201 aa  53.1  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0513  transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 
193 aa  52.8  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.826847 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1071  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
240 aa  52.8  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0612  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 
204 aa  52  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  32.17 
 
 
222 aa  52  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2712  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 
206 aa  51.6  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 
232 aa  52  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
228 aa  52  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 
244 aa  51.6  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 
195 aa  51.2  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 
197 aa  51.6  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
226 aa  51.6  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3603  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 
205 aa  50.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162578  normal  0.242533 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1924  transcriptional regulator, TetR family  21.23 
 
 
243 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.436993 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5643  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
224 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240264  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 
223 aa  51.2  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1776  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 
218 aa  50.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1211  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 
227 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1588  transcriptional regulator, TetR family  20.93 
 
 
243 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 
197 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2324  transcriptional regulator, TetR family  26.58 
 
 
195 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1642  regulatory protein TetR  21.23 
 
 
243 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.906249  normal  0.298485 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1464  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 
210 aa  50.4  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
204 aa  50.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1420  hypothetical protein  32.91 
 
 
101 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57852  normal  0.215319 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  25.83 
 
 
204 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 
210 aa  50.1  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
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NC_010505  Mrad2831_0918  TetR family transcriptional regulator  21.74 
 
 
191 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.141078 
 
 
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NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 
197 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 
203 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  25.28 
 
 
244 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal 
 
 
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NC_013757  Gobs_1746  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 
195 aa  49.7  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
213 aa  49.7  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011894  Mnod_1122  transcriptional regulator, TetR family  25.96 
 
 
242 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0273535  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 
220 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
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NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
220 aa  49.3  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
199 aa  49.3  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
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NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 
199 aa  49.3  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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