More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1872 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_1872  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 204 aa  421  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2679  transcriptional regulator, TetR family  78.43 
 
 		 204 aa  342  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2192  regulatory protein, TetR  76.47 
 
 		 204 aa  330  7.000000000000001e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0820152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3141  TetR family transcriptional regulator  80.65 
 
 		 204 aa  320  7e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1558  transcriptional regulator, TetR family  77.6 
 
 		 204 aa  317  7e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.231141  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3300  TetR family transcriptional regulator  62.75 
 
 		 204 aa  272  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2425  TetR family transcriptional regulator  62.75 
 
 		 204 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal  0.599881 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6140  TetR family transcriptional regulator  66.49 
 
 		 205 aa  265  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.943652 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1297  TetR family transcriptional regulator  66.49 
 
 		 205 aa  265  4e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.843552  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6533  TetR family transcriptional regulator  66.49 
 
 		 205 aa  265  4e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0939  TetR family transcriptional regulator  64.43 
 
 		 205 aa  265  5e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6577  TetR family transcriptional regulator  64.95 
 
 		 205 aa  261  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6291  TetR family transcriptional regulator  64.43 
 
 		 205 aa  260  8e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170422  normal  0.0225355 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3548  TetR family transcriptional regulator  63.19 
 
 		 207 aa  241  6e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2481  TetR family transcriptional regulator  58.46 
 
 		 206 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5641  regulatory protein, TetR  63.89 
 
 		 205 aa  236  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3207  putative transcription regulator protein  60.99 
 
 		 204 aa  234  7e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00713158  normal  0.0476395 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5361  transcriptional regulator, TetR family  57.22 
 
 		 205 aa  234  9e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296046  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46570  putative transcriptional regulator  60.99 
 
 		 205 aa  228  4e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161907  hitchhiker  0.00000116969 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3444  TetR family transcriptional regulator  60.44 
 
 		 205 aa  228  5e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3319  transcriptional regulator, TetR family  59.67 
 
 		 205 aa  227  7e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0822  transcriptional regulator, TetR family  57.46 
 
 		 205 aa  219  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.752802  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5655  TetR family transcriptional regulator  54.64 
 
 		 205 aa  218  7e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0301112  normal  0.0166104 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5104  TetR family transcriptional regulator  51.69 
 
 		 205 aa  207  6e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1000  transcriptional regulator, TetR family  47.42 
 
 		 202 aa  190  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6237  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 204 aa  186  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.250294  normal  0.446462 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1358  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.824963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4220  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 204 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.267151 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3471  transcriptional regulator, TetR family  36.43 
 
 		 202 aa  94  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3759  transcriptional regulator, TetR family  36.43 
 
 		 202 aa  94  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.341264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5473  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  91.3  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.0284284 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2216  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 203 aa  89.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0817319 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0096  transcriptional regulator, TetR family  36.57 
 
 		 196 aa  88.2  7e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4072  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 204 aa  88.2  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 200 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4900  transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 		 204 aa  85.1  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1083  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.243709  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1520  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431113 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1522  regulatory protein TetR  32 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.485337 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1801  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882167  normal  0.119004 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3772  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.392718  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4377  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314155  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3745  transcriptional regulator, TetR family  28.37 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2825  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2750  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 205 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172363  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3603  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162578  normal  0.242533 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 184 aa  62  0.000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1755  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0918  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.141078 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1588  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1642  regulatory protein TetR  28.05 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.906249  normal  0.298485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1924  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.436993 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5814  transcriptional regulator, TetR family  30.9 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5351  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124857 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2863  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603343 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0513  transcriptional regulator, TetR family  28.75 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.826847 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1344  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000662672 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2189  TetR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1008  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1080  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1684  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 228 aa  52.8  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.828148  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1177  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3368  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 229 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.823068  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 470 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1776  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0991  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 190 aa  52  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0995  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 190 aa  52  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1237  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 190 aa  52  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1159  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 190 aa  52  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2779  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0995  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 190 aa  52  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.713352  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  34.38 
 
 		 225 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1122  transcriptional regulator, TetR family  28.68 
 
 		 242 aa  52  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0273535  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0226  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 201 aa  51.6  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312291  hitchhiker  0.00018932 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0252  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 201 aa  51.6  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323074 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2782  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 201 aa  51.6  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.522237  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0243  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 201 aa  51.6  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0324  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 201 aa  51.6  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0304  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 201 aa  51.6  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.826155  hitchhiker  0.000375508 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0013  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3423  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0289  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3668  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0040426  hitchhiker  0.0000000599644 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3781  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3842  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391648  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3212  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3103  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.454868  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0106  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156451  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1978  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1440  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0208928 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3531  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>