More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0972 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 233 aa  471  1e-132  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 210 aa  181  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 212 aa  155  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5887  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825874 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5076  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5784  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6095  regulatory protein, TetR  25.48 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.584059  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  29.95 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4394  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 198 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 189 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1789  TetR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.484582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3699  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.158617  normal  0.554277 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  42.5 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  37.66 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  41.25 
 
 		 216 aa  65.1  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5677  regulatory protein  31.07 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.106455  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1610  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 424 aa  62  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  29.03 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0361  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.23201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  39.08 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  40.91 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6216  transcriptional regulator, TetR family  25.85 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  33 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0153  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  22.91 
 
 		 335 aa  58.9  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  27.42 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  25.54 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3198  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00193732  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 243 aa  57  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0142  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 288 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1036  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 288 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3297  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 98 aa  57  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.368335  normal  0.535572 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2630  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 321 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>