More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6095 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6095  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 204 aa  412  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.584059  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 205 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3699  TetR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 204 aa  167  9e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.158617  normal  0.554277 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0153  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 193 aa  165  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1789  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 210 aa  152  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.484582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  41.62 
 
 		 210 aa  148  5e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  41.62 
 
 		 210 aa  148  6e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5887  TetR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 212 aa  146  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825874 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1173  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 218 aa  122  3e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0133  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14044 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3240  putative transcriptional regulator, TetR family  34.23 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00194759  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 241 aa  61.6  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3314  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  38.37 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  37.21 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 230 aa  53.9  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1681  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 216 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.977422 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01975  hypothetical protein  48.98 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.10817  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 216 aa  52.4  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 224 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 224 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4203  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0570722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 224 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 202 aa  52  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  27.7 
 
 		 197 aa  52  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35360  transcriptional regulator  34.69 
 
 		 250 aa  52  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 202 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 224 aa  52  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 240 aa  51.6  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0144  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 181 aa  52  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 215 aa  51.6  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 248 aa  51.6  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3297  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 98 aa  51.6  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.368335  normal  0.535572 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3979  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 222 aa  51.6  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 201 aa  51.6  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3234  transcriptional regulator, TetR family  24.48 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1610  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 424 aa  51.2  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  34.48 
 
 		 280 aa  50.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  41.25 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0119  TetR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000566826  decreased coverage  0.00000000000241144 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 245 aa  50.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10308  TetR/AcrR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000336223  normal  0.125099 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3873  regulatory protein TetR  36.76 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1646  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 233 aa  50.1  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1640  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 393 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  36.54 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3329  transcriptional regulator, TetR family  24.05 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000330103  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 309 aa  50.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 230 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 256 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 238 aa  49.3  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 225 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 197 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 197 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 197 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  28.15 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>