More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3466 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  408  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  59.8 
 
 		 200 aa  261  4.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 196 aa  150  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
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NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 		 196 aa  147  8e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0951  TetR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 196 aa  144  9e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  36.6 
 
 		 195 aa  136  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 205 aa  132  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_1045  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 203 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00830488  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 197 aa  105  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1903  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000201758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1833  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 202 aa  96.7  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.150168  normal  0.286062 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 202 aa  95.5  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 202 aa  94.4  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2686  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 202 aa  94  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0616794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1283  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 199 aa  94.4  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_1250  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 202 aa  94  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3835  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 202 aa  93.6  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3852  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 202 aa  93.6  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1920  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 202 aa  93.6  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1684  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 202 aa  92.8  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  25.76 
 
 		 213 aa  92  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
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NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  25.65 
 
 		 199 aa  91.3  9e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2178  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 181 aa  90.9  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000638624  hitchhiker  0.00000363527 
 
 
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NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 194 aa  89.7  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
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NC_007908  Rfer_3622  TetR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 236 aa  88.6  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.311842  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 195 aa  87.8  9e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1046  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 201 aa  86.3  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1059  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 212 aa  85.5  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659814 
 
 
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NC_010524  Lcho_3254  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 199 aa  85.1  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0144  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 202 aa  85.1  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1240  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013173  Dbac_0104  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008687  Pden_3302  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.696216 
 
 
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NC_013173  Dbac_1926  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.930045  n/a   
 
 
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NC_007298  Daro_1674  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.997457 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1334  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1915  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_3094  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011060  Ppha_1325  transcriptional regulator, TetR family  24.47 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.161657  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  27.78 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  27.78 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
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NC_011992  Dtpsy_1307  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  24.26 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
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NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
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NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_0391  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.799275  normal  0.207381 
 
 
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NC_013595  Sros_3229  putative transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.446849 
 
 
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NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
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NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  38.71 
 
 		 278 aa  64.7  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
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NC_010730  SYO3AOP1_0355  transcriptional regulator, TetR family  23.64 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0899  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.494549  n/a   
 
 
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NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  26.54 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.508898 
 
 
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NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  26.54 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal  1 
 
 
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NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  24.88 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  24.88 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
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NC_013204  Elen_2214  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 219 aa  62  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.411668  normal  0.665917 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3834  transcriptional regulator, TetR family  27.44 
 
 		 218 aa  62  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1362  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 139 aa  62  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6216  transcriptional regulator, TetR family  28.08 
 
 		 208 aa  62  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1473  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  40.96 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1594  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000148614  unclonable  0.000000209189 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
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NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  22.34 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_3739  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461772  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_5096  transcriptional regulator, TetR family  27.95 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841888  normal  0.375957 
 
 
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NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
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NC_008705  Mkms_3812  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.246252 
 
 
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NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
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NC_004578  PSPTO_5146  transcriptional regulator PhaD  40.3 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_1369  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
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NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
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NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
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