294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1334 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1334  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 241 aa  493  9.999999999999999e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 201 aa  141  9e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  27.95 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1045  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 203 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00830488  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0951  TetR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2178  TetR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000638624  hitchhiker  0.00000363527 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  25.43 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  25.91 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 201 aa  64.7  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  20.11 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  18.86 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0777  nucleoid occlusion protein  23.35 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  26.86 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1903  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000201758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  47.06 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 208 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3521  nucleoid occlusion protein  22.9 
 
 		 240 aa  53.5  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  50.98 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3234  transcriptional regulator, TetR family  24.67 
 
 		 191 aa  52.8  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1590  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 192 aa  52.8  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2735  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 242 aa  52.8  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.329672  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4136  nucleoid occlusion protein  25 
 
 		 224 aa  52.4  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.925695  hitchhiker  0.00000191569 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 194 aa  52  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0542  nucleoid occlusion protein  27.55 
 
 		 214 aa  51.6  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0267  HTH-type transcriptional regulator, tetR-family  28.3 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0501  nucleoid occlusion protein  26.53 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.957497  normal  0.22516 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  22.09 
 
 		 199 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 198 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0589  nucleoid occlusion protein  23.81 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45381  normal  0.299357 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2012  nucleoid occlusion protein  24.1 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3462  regulatory protein TetR  44.23 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249959  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1167  regulatory protein, TetR  27.86 
 
 		 227 aa  49.7  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 195 aa  49.3  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  24.06 
 
 		 195 aa  49.3  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  24.06 
 
 		 195 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2332  transcriptional regulator, TetR family  23.74 
 
 		 193 aa  49.3  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.950158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1037  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 226 aa  49.7  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2276  TetR family transcriptional regulator  20.48 
 
 		 403 aa  49.3  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 195 aa  49.3  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  24.06 
 
 		 195 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 195 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 222 aa  49.3  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0031  nucleoid occlusion protein  25.15 
 
 		 218 aa  48.9  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1929  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 210 aa  48.9  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.434465  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1338  TetR family regulatory protein  27.7 
 
 		 210 aa  48.9  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  21.56 
 
 		 202 aa  48.9  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3979  nucleoid occlusion protein  27.55 
 
 		 216 aa  48.9  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.56213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0307  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 210 aa  48.9  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.45423  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1024  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 210 aa  48.9  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.420909  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0841  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 210 aa  48.9  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1177  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 210 aa  48.9  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1185  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 210 aa  48.9  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193625  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  24.42 
 
 		 201 aa  48.9  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0142  nucleoid occlusion protein  26.06 
 
 		 216 aa  48.9  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.219358 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  18.93 
 
 		 205 aa  48.9  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 202 aa  48.5  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 195 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  21.52 
 
 		 204 aa  48.5  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2575  transcriptional regulator, TetR family  21.31 
 
 		 196 aa  48.1  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.230257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  22.16 
 
 		 236 aa  48.5  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 195 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00128  TetR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0837  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.895795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1729  nucleoid occlusion protein  24.1 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3850  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 207 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349935 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0569  nucleoid occlusion protein  23.28 
 
 		 214 aa  48.5  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002240  transcriptional regulator TetR family  32.71 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 195 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8534  transcriptional regulator, TetR family  22.82 
 
 		 206 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.027806  hitchhiker  0.00115544 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2686  TetR family transcriptional regulator  20.57 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0616794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4757  regulatory protein, TetR  38.1 
 
 		 220 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0842681 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0182  nucleoid occlusion protein  24.47 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847466  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 210 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 195 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0972  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.299865  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4669  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 197 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3835  TetR family transcriptional regulator  20.57 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3852  TetR family transcriptional regulator  20.57 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1920  TetR family transcriptional regulator  20.57 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 		 246 aa  47.8  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0059  nucleoid occlusion protein  28.68 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0445493  normal  0.11202 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2329  TetR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 186 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143879 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 217 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 226 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2840  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 238 aa  47  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  26.79 
 
 		 197 aa  47  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1250  TetR family transcriptional regulator  20.57 
 
 		 202 aa  47  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 220 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  21.95 
 
 		 217 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5697  TetR family transcriptional regulator  22.17 
 
 		 220 aa  46.6  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>