More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4757 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4757  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 220 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0842681 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0419  transcriptional reguator, TetR family  89.5 
 
 		 220 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5344  TetR family transcriptional regulator  68.95 
 
 		 223 aa  317  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4993  TetR family transcriptional regulator  68.95 
 
 		 221 aa  312  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0346  TetR family transcriptional regulator  68.95 
 
 		 221 aa  311  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202764  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5119  TetR family transcriptional regulator  68.49 
 
 		 221 aa  310  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5169  TetR family transcriptional regulator  68.95 
 
 		 221 aa  310  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0462  putative transcriptional regulator  62.79 
 
 		 215 aa  286  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04820  TetR family transcriptional regulator  62.33 
 
 		 215 aa  285  5e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4186  TetR family transcriptional regulator  61.64 
 
 		 245 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3571  TetR family transcriptional regulator  46.98 
 
 		 227 aa  206  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.713371  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0099  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0469573  hitchhiker  0.000212753 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3937  transcriptional regulator, TetR family protein  38 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.353211  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4675  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 215 aa  143  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3899  TetR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 215 aa  142  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3991  TetR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 215 aa  142  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4479  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 215 aa  141  8e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4339  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 215 aa  141  9e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0059  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 215 aa  141  9e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0273669  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4284  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 215 aa  141  9e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000936887 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4103  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 215 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0350269  normal  0.346351 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3900  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.113348  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2735  TetR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 242 aa  139  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.329672  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0108  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 213 aa  137  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0102  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 218 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.478027 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0066  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  hitchhiker  0.0000133916 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0103  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.462043 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3708  TetR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.59565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0388  TetR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00128  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0938  TetR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1272  TetR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1410  TetR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0318904  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1037  TetR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397518  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0761  TetR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1265  TetR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002240  transcriptional regulator TetR family  35.33 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0267  HTH-type transcriptional regulator, tetR-family  32.5 
 
 		 214 aa  128  6e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1914  transcriptional regulator, TetR family  36.32 
 
 		 239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2030  TetR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 238 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0233695  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1661  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 252 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2296  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 252 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2273  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 252 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2237  transcriptional regulator, TetR family  36.79 
 
 		 236 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1005  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 244 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2311  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 251 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2189  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 251 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.533648  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1857  TetR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 239 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5600  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 252 aa  125  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1105  TetR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 253 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2086  putative transcription regulator protein  36.32 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1320  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 241 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767739  normal  0.281979 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3239  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 241 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3496  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 223 aa  122  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.591625 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0901  TetR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 236 aa  121  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3529  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 220 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.270662  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3614  regulatory protein, TetR  32.52 
 
 		 215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0205  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 208 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.555741  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4167  TetR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4025  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.272144  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0825  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 222 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1491  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 209 aa  109  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0204  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 191 aa  105  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0122947  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4798  transcriptional regulator, TetR family  32.87 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0349  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0214  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.705047  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0551  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 220 aa  101  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0535  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 217 aa  100  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0588697 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0527  TetR family transcriptional regulator  44.25 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0603321  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5146  transcriptional regulator PhaD  34.13 
 
 		 204 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0458  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 204 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1293  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 213 aa  95.1  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5056  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 204 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0391  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.799275  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4880  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 204 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5006  TetR family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 204 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5798  putative transcriptional regulator  30.92 
 
 		 205 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66850  TetR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 205 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1581  TetR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.223478 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5452  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1089  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.485393  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01158  transcriptional regulator PhaD  35.96 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.334041  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1828  regulatory protein TetR  34.51 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
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NC_009511  Swit_4170  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0130344  normal  0.052898 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 184 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
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NC_011981  Avi_7032  transcriptional regulator TetR family  32.26 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  51.02 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 191 aa  52.4  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 216 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
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NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 206 aa  51.6  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.693202 
 
 
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NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 195 aa  51.6  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 216 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013165  Shel_28060  transcriptional regulator  44.23 
 
 		 204 aa  51.6  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.633688  normal  1 
 
 
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NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 216 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 200 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
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NC_013518  Sterm_4190  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.74511  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 185 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
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NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
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NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 269 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
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NC_013530  Xcel_3070  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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