162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4669 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4669  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 197 aa  402  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1020  TetR family transcriptional regulator  37.81 
 
 		 198 aa  131  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13954 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3294  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 198 aa  117  9e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3199  transcriptional regulator, TetR family  38.15 
 
 		 198 aa  117  9e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0468642  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6800  putative transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1231  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.811741  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3099  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 221 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00451486  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0058  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 216 aa  106  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5083  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 193 aa  105  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0154  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 201 aa  95.9  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.01505  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2858  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 218 aa  95.1  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0070  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 202 aa  95.5  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1225  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 269 aa  94.4  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000947  transcriptional regulator  30.81 
 
 		 196 aa  93.6  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0088  transcriptional regulator, TetR family  38.02 
 
 		 207 aa  93.2  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4033  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 219 aa  92.8  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000937448 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2565  transcriptional regulator, TetR family  37 
 
 		 195 aa  91.7  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.908518  normal  0.0361185 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0472  putative transcription regulator protein  29.41 
 
 		 213 aa  90.9  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.19326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4039  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 199 aa  89.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.105463  normal  0.161647 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0660  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 199 aa  89.4  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0420  TetR family regulatory protein  30.56 
 
 		 226 aa  89.4  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.418633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0384  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 201 aa  89.4  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.384249  normal  0.354383 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1907  putative transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 218 aa  89  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0445  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 213 aa  89  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0384  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 212 aa  89  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.422043  normal  0.0982604 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3478  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 247 aa  87.8  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.346656  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06958  transcriptional regulator  29.29 
 
 		 198 aa  87.8  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0196  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.784528  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0855  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0563  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0591  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 221 aa  87.4  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.581087 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2749  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2329  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0679  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0694  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357828  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2409  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0362  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0347  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0570  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 221 aa  86.3  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6049  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 199 aa  86.3  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2773  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 199 aa  86.3  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2640  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 199 aa  86.3  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308303  normal  0.133482 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1336  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 235 aa  86.3  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.745896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3520  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 236 aa  85.9  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5178  putative transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 197 aa  85.5  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.519918  hitchhiker  0.00157317 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4090  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 342 aa  85.1  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729082 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0577  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 199 aa  85.5  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2110  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2749  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2722  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40024  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3958  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2281  hypothetical protein  33.81 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120566  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0809  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3921  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12190  hypothetical protein  42.05 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.52928e-50  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3074  transcriptional regulator, TetR family  38.53 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3420  transcriptional regulator, TetR family  37.61 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4372  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 224 aa  72  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0837582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0119  TetR family transcriptional regulator  22.16 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.207214 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0062  transcriptional regulator, TetR family  24.32 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2862  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00162474  hitchhiker  0.00695972 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 191 aa  53.9  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3375  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 195 aa  51.2  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0741  regulatory protein, TetR  25.85 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  22.98 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0035  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00656395  normal  0.0912126 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  27.16 
 
 		 197 aa  49.3  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3395  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 193 aa  49.3  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.584176  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  23.97 
 
 		 196 aa  48.5  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C37  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 199 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0068  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 193 aa  48.1  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3453  transcriptional regulator, TetR family  21.03 
 
 		 196 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0161587  hitchhiker  4.69207e-17 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1334  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 241 aa  47.8  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3677  transcriptional regulator, TetR family  26.62 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503409  normal  0.650375 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  23.2 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3810  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1893  transcriptional regulator, TetR family  21.03 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0175452  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0055  TetR family transcriptional regulator  20.51 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.727514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1013  transcriptional regulator, TetR family  20.51 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 196 aa  45.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 209 aa  45.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  22.29 
 
 		 189 aa  45.4  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3208  TetR family transcriptional regulator  20.25 
 
 		 196 aa  45.1  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000777782  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3448  transcriptional regulator, TetR family  20.25 
 
 		 196 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3234  TetR family transcriptional regulator  20.25 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2157  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105803  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>