More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1336 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1336  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
235 aa  481  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.745896  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0591  TetR family transcriptional regulator  78.33 
 
 
221 aa  333  2e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.581087 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0570  transcriptional regulator, TetR family  77.83 
 
 
221 aa  331  7.000000000000001e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4090  TetR family transcriptional regulator  73.73 
 
 
342 aa  328  5.0000000000000004e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.729082 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1225  TetR family transcriptional regulator  79.08 
 
 
269 aa  320  1.9999999999999998e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0809  transcriptional regulator, TetR family  76.12 
 
 
233 aa  304  6e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3958  TetR family transcriptional regulator  72.86 
 
 
260 aa  302  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3478  TetR family transcriptional regulator  72.36 
 
 
247 aa  295  3e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.346656  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0420  TetR family regulatory protein  65.9 
 
 
226 aa  290  1e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.418633  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3520  TetR family transcriptional regulator  67.94 
 
 
236 aa  289  3e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4033  TetR family transcriptional regulator  64.62 
 
 
219 aa  287  1e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000937448 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0384  TetR family transcriptional regulator  55.17 
 
 
212 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.422043  normal  0.0982604 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6049  TetR family transcriptional regulator  55.1 
 
 
199 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2640  TetR family transcriptional regulator  55.1 
 
 
199 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308303  normal  0.133482 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2773  TetR family transcriptional regulator  55.1 
 
 
199 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0472  putative transcription regulator protein  53.49 
 
 
213 aa  219  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.19326  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0577  TetR family transcriptional regulator  54.59 
 
 
199 aa  216  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0660  transcriptional regulator, TetR family  54.08 
 
 
199 aa  216  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0196  TetR family transcriptional regulator  53.57 
 
 
199 aa  214  9e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.784528  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0855  TetR family transcriptional regulator  53.57 
 
 
199 aa  214  9e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0679  TetR family transcriptional regulator  53.57 
 
 
199 aa  214  9e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0563  TetR family transcriptional regulator  53.57 
 
 
199 aa  214  9e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2749  TetR family transcriptional regulator  53.57 
 
 
199 aa  214  9e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2329  TetR family transcriptional regulator  53.57 
 
 
199 aa  214  9e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2409  TetR family transcriptional regulator  53.57 
 
 
199 aa  214  9e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4039  TetR family transcriptional regulator  53.57 
 
 
199 aa  214  9e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.105463  normal  0.161647 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0694  TetR family transcriptional regulator  53.57 
 
 
199 aa  214  9e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357828  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0445  TetR family transcriptional regulator  53.47 
 
 
213 aa  212  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2749  TetR family transcriptional regulator  54.08 
 
 
199 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407163  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2110  TetR family transcriptional regulator  54.08 
 
 
199 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2722  TetR family transcriptional regulator  54.08 
 
 
199 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40024  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0384  TetR family transcriptional regulator  53.03 
 
 
201 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.384249  normal  0.354383 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0362  transcriptional regulator, TetR family  53.62 
 
 
213 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0347  transcriptional regulator, TetR family  53.62 
 
 
213 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421077  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0062  transcriptional regulator, TetR family  46.63 
 
 
200 aa  183  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0119  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 
200 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.207214 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1020  TetR family transcriptional regulator  42.71 
 
 
198 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.13954 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3099  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 
221 aa  155  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00451486  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1231  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
196 aa  149  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.811741  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3199  transcriptional regulator, TetR family  38.38 
 
 
198 aa  148  6e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0468642  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3294  transcriptional regulator, TetR family  38.38 
 
 
198 aa  147  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5083  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 
193 aa  135  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2565  transcriptional regulator, TetR family  38.54 
 
 
195 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.908518  normal  0.0361185 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3921  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
201 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0070  transcriptional regulator, TetR family  36.32 
 
 
202 aa  126  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128358  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4372  TetR/AcrR family transcriptional regulator  37.08 
 
 
224 aa  125  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0837582  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5178  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
197 aa  118  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.519918  hitchhiker  0.00157317 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0058  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 
216 aa  116  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0088  transcriptional regulator, TetR family  36.13 
 
 
207 aa  116  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783228  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000947  transcriptional regulator  32.31 
 
 
196 aa  111  9e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0154  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.01505  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2858  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6800  putative transcriptional regulator, TetR family  37.89 
 
 
207 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813677  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06958  transcriptional regulator  31.79 
 
 
198 aa  99.4  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3420  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 
202 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12190  hypothetical protein  52.27 
 
 
211 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.52928e-50  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3074  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 
202 aa  92.8  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1907  putative transcriptional regulator, TetR family  32.78 
 
 
218 aa  89.7  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2281  hypothetical protein  36.84 
 
 
194 aa  87  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120566  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4669  TetR family transcriptional regulator  32.92 
 
 
197 aa  86.3  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 
199 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 
201 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3677  transcriptional regulator, TetR family  22.96 
 
 
196 aa  61.6  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503409  normal  0.650375 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  21.31 
 
 
198 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  26.19 
 
 
212 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26140  putative transcriptional regulator  29.82 
 
 
196 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287141  normal  0.149256 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
194 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  28.57 
 
 
195 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3078  regulatory protein, TetR  27.86 
 
 
203 aa  54.7  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.745436  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 
190 aa  54.7  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  26.85 
 
 
196 aa  54.7  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  24.26 
 
 
200 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0815  TetR family transcriptional regulator  25.57 
 
 
196 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.642279  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4537  transcriptional regulator, TetR family  22.09 
 
 
197 aa  53.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340013  normal  0.0119033 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5165  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 
194 aa  53.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.707616 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 
207 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 
193 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  27.64 
 
 
211 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1076  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
206 aa  52.8  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 
205 aa  52.4  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 
200 aa  52.4  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 
206 aa  52  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0900  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 
193 aa  52  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308807  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  21.05 
 
 
200 aa  52  0.000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  27.13 
 
 
220 aa  52  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2793  TetR family transcriptional regulator  24.11 
 
 
214 aa  52  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1735  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 
214 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2807  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 
214 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 
195 aa  51.6  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  23.3 
 
 
194 aa  51.6  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3169  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 
214 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0031  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 
214 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5345  TetR family transcriptional regulator  27.52 
 
 
198 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.922777  normal  0.179588 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4995  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
224 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11542  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0685  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 
232 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3614  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 
218 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0502  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 
224 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0573  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 
232 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0810713  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3603  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 
214 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48420  putative transcriptional regulator  35.06 
 
 
202 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0011363  normal  0.230392 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>