187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4090 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4090  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 342 aa  700    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729082 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0570  transcriptional regulator, TetR family  84.83 
 
 		 221 aa  365  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0591  TetR family transcriptional regulator  83.89 
 
 		 221 aa  361  1e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.581087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1225  TetR family transcriptional regulator  74.06 
 
 		 269 aa  345  5e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1336  TetR family transcriptional regulator  73.73 
 
 		 235 aa  324  1e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.745896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3958  TetR family transcriptional regulator  78.46 
 
 		 260 aa  314  1.9999999999999998e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3478  TetR family transcriptional regulator  73.08 
 
 		 247 aa  310  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.346656  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0809  transcriptional regulator, TetR family  76.77 
 
 		 233 aa  310  2.9999999999999997e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3520  TetR family transcriptional regulator  69.27 
 
 		 236 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4033  TetR family transcriptional regulator  66.51 
 
 		 219 aa  295  9e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000937448 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0420  TetR family regulatory protein  64.15 
 
 		 226 aa  277  2e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.418633  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0472  putative transcription regulator protein  55.56 
 
 		 213 aa  229  6e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.19326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0384  TetR family transcriptional regulator  56.19 
 
 		 212 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.422043  normal  0.0982604 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4039  TetR family transcriptional regulator  54.08 
 
 		 199 aa  222  8e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.105463  normal  0.161647 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2640  TetR family transcriptional regulator  55.15 
 
 		 199 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308303  normal  0.133482 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6049  TetR family transcriptional regulator  55.15 
 
 		 199 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2773  TetR family transcriptional regulator  55.15 
 
 		 199 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0660  transcriptional regulator, TetR family  53.57 
 
 		 199 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0577  TetR family transcriptional regulator  54.64 
 
 		 199 aa  219  7e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0384  TetR family transcriptional regulator  54.12 
 
 		 201 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.384249  normal  0.354383 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2110  TetR family transcriptional regulator  54.12 
 
 		 199 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2722  TetR family transcriptional regulator  54.12 
 
 		 199 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40024  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2749  TetR family transcriptional regulator  54.12 
 
 		 199 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0445  TetR family transcriptional regulator  54.64 
 
 		 213 aa  216  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0196  TetR family transcriptional regulator  53.09 
 
 		 199 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.784528  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0855  TetR family transcriptional regulator  53.09 
 
 		 199 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0563  TetR family transcriptional regulator  53.09 
 
 		 199 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2749  TetR family transcriptional regulator  53.09 
 
 		 199 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2329  TetR family transcriptional regulator  53.09 
 
 		 199 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0679  TetR family transcriptional regulator  53.09 
 
 		 199 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0694  TetR family transcriptional regulator  53.09 
 
 		 199 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357828  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2409  TetR family transcriptional regulator  53.09 
 
 		 199 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0347  transcriptional regulator, TetR family  56.19 
 
 		 213 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0362  transcriptional regulator, TetR family  56.19 
 
 		 213 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0062  transcriptional regulator, TetR family  45.64 
 
 		 200 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0119  TetR family transcriptional regulator  41.97 
 
 		 200 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.207214 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1020  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 198 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13954 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3099  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 221 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00451486  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1231  TetR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 196 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.811741  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3199  transcriptional regulator, TetR family  40.12 
 
 		 198 aa  142  9e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0468642  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3294  transcriptional regulator, TetR family  40.12 
 
 		 198 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5083  transcriptional regulator, TetR family  36.32 
 
 		 193 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2565  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 195 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.908518  normal  0.0361185 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3921  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 201 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0070  transcriptional regulator, TetR family  36.04 
 
 		 202 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4372  TetR/AcrR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 224 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0837582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0058  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 		 216 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0088  transcriptional regulator, TetR family  36.04 
 
 		 207 aa  115  8.999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0154  transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 		 201 aa  112  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.01505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6800  putative transcriptional regulator, TetR family  39.18 
 
 		 207 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000947  transcriptional regulator  33.85 
 
 		 196 aa  109  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2858  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 218 aa  109  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5178  putative transcriptional regulator, TetR family  35.88 
 
 		 197 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.519918  hitchhiker  0.00157317 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06958  transcriptional regulator  31.79 
 
 		 198 aa  95.1  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1907  putative transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 218 aa  90.5  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12190  hypothetical protein  52.27 
 
 		 211 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.52928e-50  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3420  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 202 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4669  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 197 aa  85.1  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3074  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 202 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2281  hypothetical protein  36.36 
 
 		 194 aa  81.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120566  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 201 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0550  regulatory protein, TetR  26.09 
 
 		 199 aa  58.2  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3375  TetR family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 196 aa  54.7  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  25.43 
 
 		 198 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3677  transcriptional regulator, TetR family  22.16 
 
 		 196 aa  53.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503409  normal  0.650375 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 198 aa  53.9  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1679  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 185 aa  53.9  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 190 aa  53.1  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 222 aa  52.8  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0815  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 196 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.642279  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4537  transcriptional regulator, TetR family  21.47 
 
 		 197 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340013  normal  0.0119033 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 207 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 200 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 200 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3183  TetR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 207 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1186  transcriptional regulator, TetR family  24.57 
 
 		 206 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3182  TetR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 207 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3326  TetR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 207 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001160  transcriptional regulator  23.53 
 
 		 181 aa  49.7  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1000  regulatory protein, TetR  28.4 
 
 		 242 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.6882 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3078  regulatory protein, TetR  25 
 
 		 203 aa  49.7  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.745436  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  24.85 
 
 		 225 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3418  transcriptional regulator protein  23.72 
 
 		 193 aa  48.9  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 193 aa  48.5  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  25.34 
 
 		 196 aa  48.9  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4844  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 252 aa  48.5  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  21.64 
 
 		 200 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2884  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 202 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2793  TetR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 214 aa  48.1  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  21.64 
 
 		 200 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2801  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 202 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1076  TetR family transcriptional regulator  22.77 
 
 		 206 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  20.96 
 
 		 198 aa  47.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26140  putative transcriptional regulator  27.06 
 
 		 196 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287141  normal  0.149256 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3089  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 204 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1393  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 205 aa  47  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 206 aa  47  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>