266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0591 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0591  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 221 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.581087 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0570  transcriptional regulator, TetR family  99.1 
 
 		 221 aa  454  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4090  TetR family transcriptional regulator  83.89 
 
 		 342 aa  361  5.0000000000000005e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729082 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1225  TetR family transcriptional regulator  82.05 
 
 		 269 aa  335  1.9999999999999998e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1336  TetR family transcriptional regulator  78.97 
 
 		 235 aa  328  4e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.745896  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0809  transcriptional regulator, TetR family  73.58 
 
 		 233 aa  318  6e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3478  TetR family transcriptional regulator  72.22 
 
 		 247 aa  316  2e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.346656  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3958  TetR family transcriptional regulator  75.9 
 
 		 260 aa  313  9.999999999999999e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3520  TetR family transcriptional regulator  70.7 
 
 		 236 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4033  TetR family transcriptional regulator  66.02 
 
 		 219 aa  290  9e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000937448 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0420  TetR family regulatory protein  64.62 
 
 		 226 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.418633  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0472  putative transcription regulator protein  55.67 
 
 		 213 aa  224  8e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.19326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6049  TetR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 199 aa  223  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2640  TetR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 199 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308303  normal  0.133482 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2773  TetR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 199 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0384  TetR family transcriptional regulator  55.15 
 
 		 212 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.422043  normal  0.0982604 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0577  TetR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 199 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4039  TetR family transcriptional regulator  52.04 
 
 		 199 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.105463  normal  0.161647 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0660  transcriptional regulator, TetR family  51.53 
 
 		 199 aa  218  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0384  TetR family transcriptional regulator  51.53 
 
 		 201 aa  215  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.384249  normal  0.354383 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0196  TetR family transcriptional regulator  51.53 
 
 		 199 aa  214  7e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.784528  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0855  TetR family transcriptional regulator  51.53 
 
 		 199 aa  214  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0563  TetR family transcriptional regulator  51.53 
 
 		 199 aa  214  7e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0694  TetR family transcriptional regulator  51.53 
 
 		 199 aa  214  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357828  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2409  TetR family transcriptional regulator  51.53 
 
 		 199 aa  214  7e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2749  TetR family transcriptional regulator  51.53 
 
 		 199 aa  214  7e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2329  TetR family transcriptional regulator  51.53 
 
 		 199 aa  214  7e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0679  TetR family transcriptional regulator  51.53 
 
 		 199 aa  214  7e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2110  TetR family transcriptional regulator  51.53 
 
 		 199 aa  214  8e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2722  TetR family transcriptional regulator  51.53 
 
 		 199 aa  214  8e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40024  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2749  TetR family transcriptional regulator  51.53 
 
 		 199 aa  214  8e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0445  TetR family transcriptional regulator  53.61 
 
 		 213 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0362  transcriptional regulator, TetR family  52.4 
 
 		 213 aa  209  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0347  transcriptional regulator, TetR family  52.4 
 
 		 213 aa  209  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0062  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 200 aa  178  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1020  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 198 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13954 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0119  TetR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 200 aa  161  9e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.207214 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3099  TetR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00451486  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1231  TetR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.811741  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3199  transcriptional regulator, TetR family  40.12 
 
 		 198 aa  145  6e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0468642  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3294  transcriptional regulator, TetR family  40.12 
 
 		 198 aa  144  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5083  transcriptional regulator, TetR family  36.32 
 
 		 193 aa  132  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2565  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.908518  normal  0.0361185 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0070  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 202 aa  122  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3921  TetR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0058  transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 		 216 aa  115  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0088  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 207 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6800  putative transcriptional regulator, TetR family  38.01 
 
 		 207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5178  putative transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.519918  hitchhiker  0.00157317 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4372  TetR/AcrR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 224 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0837582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0154  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.01505  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2858  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000947  transcriptional regulator  31.79 
 
 		 196 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06958  transcriptional regulator  31.31 
 
 		 198 aa  92.4  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1907  putative transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 218 aa  90.9  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12190  hypothetical protein  51.14 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.52928e-50  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4669  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 197 aa  87.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3420  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 202 aa  85.5  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3074  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2281  hypothetical protein  32.81 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120566  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  25.25 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4537  transcriptional regulator, TetR family  23.74 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340013  normal  0.0119033 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3984  transcriptional regulator, TetR family protein  28.67 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 198 aa  53.5  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0773  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 224 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2087  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 232 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390005  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0502  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 224 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1638  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 232 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3078  regulatory protein, TetR  25.52 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.745436  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0573  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 232 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0810713  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1991  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 232 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0685  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 232 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 198 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 206 aa  52.8  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1186  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3182  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 193 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3326  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2862  TetR family transcriptional regulator  20.36 
 
 		 202 aa  52  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00162474  hitchhiker  0.00695972 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1679  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 185 aa  52.4  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3183  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0815  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 196 aa  52  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.642279  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3677  transcriptional regulator, TetR family  22.16 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503409  normal  0.650375 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2898  TetR family transcriptional regulator  22.65 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.881728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001160  transcriptional regulator  24.14 
 
 		 181 aa  50.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5165  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 194 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.707616 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2606  TetR family transcriptional regulator  21.91 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0499  TetR family transcriptional regulator  21.91 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0430  TetR family transcriptional regulator  22.01 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1076  TetR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  23.17 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 200 aa  50.1  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>