More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1231 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1231  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 196 aa  390  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.811741  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_0070  transcriptional regulator, TetR family  53.09 
 
 		 202 aa  191  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2565  transcriptional regulator, TetR family  55.9 
 
 		 195 aa  183  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.908518  normal  0.0361185 
 
 
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NC_013947  Snas_5083  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 193 aa  179  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009675  Anae109_1020  TetR family transcriptional regulator  48.73 
 
 		 198 aa  174  6e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13954 
 
 
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NC_011891  A2cp1_3294  transcriptional regulator, TetR family  51.28 
 
 		 198 aa  163  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_3099  TetR family transcriptional regulator  51.15 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00451486  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_3199  transcriptional regulator, TetR family  50.77 
 
 		 198 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0468642  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_0088  transcriptional regulator, TetR family  50.52 
 
 		 207 aa  159  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783228  normal  1 
 
 
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NC_007348  Reut_B3921  TetR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 201 aa  155  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012791  Vapar_0809  transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 233 aa  155  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3520  TetR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 236 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4033  TetR family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000937448 
 
 
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NC_008781  Pnap_3478  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 247 aa  153  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.346656  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1336  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 235 aa  149  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.745896  normal  1 
 
 
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NC_008825  Mpe_A0420  TetR family regulatory protein  39.89 
 
 		 226 aa  149  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.418633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4039  TetR family transcriptional regulator  42.49 
 
 		 199 aa  149  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.105463  normal  0.161647 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4090  TetR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 342 aa  148  6e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729082 
 
 
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NC_008786  Veis_1225  TetR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 269 aa  147  8e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010681  Bphyt_0660  transcriptional regulator, TetR family  41.97 
 
 		 199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008782  Ajs_0591  TetR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.581087 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_0570  transcriptional regulator, TetR family  38.42 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003295  RSc0472  putative transcription regulator protein  40.51 
 
 		 213 aa  142  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.19326  normal  1 
 
 
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NC_010084  Bmul_0577  TetR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 199 aa  142  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0384  TetR family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 201 aa  142  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.384249  normal  0.354383 
 
 
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NC_007948  Bpro_3958  TetR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 260 aa  141  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_2749  TetR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 199 aa  141  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407163  normal  1 
 
 
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NC_008060  Bcen_2110  TetR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 199 aa  141  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_2722  TetR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 199 aa  141  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40024  n/a   
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A6049  TetR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 199 aa  140  9e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010551  BamMC406_2640  TetR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 199 aa  140  9e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308303  normal  0.133482 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2773  TetR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 199 aa  140  9e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007973  Rmet_0384  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 212 aa  140  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.422043  normal  0.0982604 
 
 
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NC_007974  Rmet_4372  TetR/AcrR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 224 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0837582  normal  1 
 
 
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NC_010682  Rpic_0347  transcriptional regulator, TetR family  38.97 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421077  normal  1 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_0362  transcriptional regulator, TetR family  38.97 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2749  TetR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 199 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0196  TetR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 199 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.784528  n/a   
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_0855  TetR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 199 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0563  TetR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 199 aa  136  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0694  TetR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 199 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357828  n/a   
 
 
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NC_009080  BMA10247_2409  TetR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 199 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A2329  TetR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 199 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_0679  TetR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 199 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007347  Reut_A0445  TetR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 213 aa  135  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013457  VEA_000947  transcriptional regulator  41.76 
 
 		 196 aa  118  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_6800  putative transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 207 aa  112  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813677  normal  1 
 
 
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NC_009784  VIBHAR_06958  transcriptional regulator  38.82 
 
 		 198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_4669  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012791  Vapar_0062  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_5178  putative transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 197 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.519918  hitchhiker  0.00157317 
 
 
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NC_014210  Ndas_2858  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 218 aa  100  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007948  Bpro_0119  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 200 aa  99.8  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.207214 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0154  transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 		 201 aa  95.5  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.01505  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_0058  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 216 aa  91.3  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010682  Rpic_3420  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 202 aa  84.7  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013441  Gbro_2281  hypothetical protein  33.11 
 
 		 194 aa  84.3  9e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120566  n/a   
 
 
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NC_013530  Xcel_1907  putative transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009565  TBFG_12190  hypothetical protein  48.89 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.52928e-50  normal  1 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_3074  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 202 aa  77.8  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
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NC_013730  Slin_3677  transcriptional regulator, TetR family  24.53 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503409  normal  0.650375 
 
 
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NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
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NC_013132  Cpin_4537  transcriptional regulator, TetR family  26.45 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340013  normal  0.0119033 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 199 aa  62  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
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NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  20.42 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  28.74 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0394  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.509635  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 198 aa  57.8  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  24.07 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5096  transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841888  normal  0.375957 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0550  regulatory protein, TetR  28.57 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2862  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00162474  hitchhiker  0.00695972 
 
 
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NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6550  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124296  normal  0.0144339 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1572  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6735  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6259  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3722  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  28.81 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 181 aa  52  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 196 aa  52.4  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  22.78 
 
 		 198 aa  52  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0696  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 194 aa  52  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  20.4 
 
 		 200 aa  51.6  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
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NC_012850  Rleg_0985  transcriptional regulator, TetR family  41.1 
 
 		 222 aa  51.6  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 222 aa  51.6  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 200 aa  51.6  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.580741 
 
 
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NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 196 aa  51.6  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
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NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  28.7 
 
 		 185 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013037  Dfer_2332  transcriptional regulator, TetR family  27.1 
 
 		 193 aa  51.2  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.950158  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 192 aa  51.2  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal  1 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_0193  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_4792  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165855  normal  0.419651 
 
 
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