257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0384 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0384  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 212 aa  432  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.422043  normal  0.0982604 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0445  TetR family transcriptional regulator  96.24 
 
 		 213 aa  412  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0472  putative transcription regulator protein  88.73 
 
 		 213 aa  386  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.19326  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0362  transcriptional regulator, TetR family  90.14 
 
 		 213 aa  374  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0347  transcriptional regulator, TetR family  90.14 
 
 		 213 aa  374  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4039  TetR family transcriptional regulator  81.12 
 
 		 199 aa  330  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.105463  normal  0.161647 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0384  TetR family transcriptional regulator  81.12 
 
 		 201 aa  328  4e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.384249  normal  0.354383 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0660  transcriptional regulator, TetR family  80.1 
 
 		 199 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0577  TetR family transcriptional regulator  79.08 
 
 		 199 aa  322  3e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6049  TetR family transcriptional regulator  78.06 
 
 		 199 aa  318  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2640  TetR family transcriptional regulator  78.06 
 
 		 199 aa  318  3e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308303  normal  0.133482 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2773  TetR family transcriptional regulator  78.06 
 
 		 199 aa  318  3e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2110  TetR family transcriptional regulator  77.55 
 
 		 199 aa  314  6e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2722  TetR family transcriptional regulator  77.55 
 
 		 199 aa  314  6e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40024  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2749  TetR family transcriptional regulator  77.55 
 
 		 199 aa  314  6e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407163  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0196  TetR family transcriptional regulator  76.53 
 
 		 199 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.784528  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0855  TetR family transcriptional regulator  76.53 
 
 		 199 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0563  TetR family transcriptional regulator  76.53 
 
 		 199 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2749  TetR family transcriptional regulator  76.53 
 
 		 199 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2329  TetR family transcriptional regulator  76.53 
 
 		 199 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0679  TetR family transcriptional regulator  76.53 
 
 		 199 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0694  TetR family transcriptional regulator  76.53 
 
 		 199 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357828  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2409  TetR family transcriptional regulator  76.53 
 
 		 199 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0809  transcriptional regulator, TetR family  59 
 
 		 233 aa  241  7.999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4033  TetR family transcriptional regulator  57.92 
 
 		 219 aa  231  4.0000000000000004e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000937448 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0420  TetR family regulatory protein  57.71 
 
 		 226 aa  230  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.418633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3958  TetR family transcriptional regulator  55.84 
 
 		 260 aa  229  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3478  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 247 aa  228  5e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.346656  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1225  TetR family transcriptional regulator  54.23 
 
 		 269 aa  224  5.0000000000000005e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4090  TetR family transcriptional regulator  56.19 
 
 		 342 aa  224  9e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729082 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0570  transcriptional regulator, TetR family  55.15 
 
 		 221 aa  223  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0591  TetR family transcriptional regulator  55.15 
 
 		 221 aa  222  4e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.581087 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1336  TetR family transcriptional regulator  54.64 
 
 		 235 aa  215  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.745896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3520  TetR family transcriptional regulator  52.06 
 
 		 236 aa  207  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0119  TetR family transcriptional regulator  49.75 
 
 		 200 aa  195  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.207214 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0062  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 200 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1020  TetR family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 198 aa  152  5e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13954 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1231  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 196 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.811741  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3199  transcriptional regulator, TetR family  43.35 
 
 		 198 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0468642  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3294  transcriptional regulator, TetR family  43.35 
 
 		 198 aa  135  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3099  TetR family transcriptional regulator  42.77 
 
 		 221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00451486  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5083  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 		 193 aa  124  8.000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0070  transcriptional regulator, TetR family  37.44 
 
 		 202 aa  122  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3921  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4372  TetR/AcrR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0837582  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0088  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0058  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 216 aa  109  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2565  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 		 195 aa  105  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.908518  normal  0.0361185 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2858  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 218 aa  105  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5178  putative transcriptional regulator, TetR family  35.88 
 
 		 197 aa  98.2  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.519918  hitchhiker  0.00157317 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0154  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 201 aa  98.2  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.01505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1907  putative transcriptional regulator, TetR family  37.95 
 
 		 218 aa  97.1  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6800  putative transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 207 aa  96.7  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000947  transcriptional regulator  33.53 
 
 		 196 aa  94  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4669  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 197 aa  89  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06958  transcriptional regulator  32.56 
 
 		 198 aa  86.7  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12190  hypothetical protein  44.32 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.52928e-50  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2281  hypothetical protein  33.33 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120566  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3420  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3074  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1076  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2793  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3494  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3326  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1186  transcriptional regulator, TetR family  28.08 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3182  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3183  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1072  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 206 aa  62  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000136093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1144  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00178929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0815  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.642279  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2547  TetR family transcriptional regulator  20.83 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.28213  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0900  TetR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 193 aa  52.8  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308807  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0875  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0892  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0881  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.929355 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5165  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 194 aa  52.4  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.707616 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  26.54 
 
 		 192 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  25.85 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  27.91 
 
 		 220 aa  51.6  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3677  transcriptional regulator, TetR family  19.64 
 
 		 196 aa  51.6  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503409  normal  0.650375 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1087  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00014413  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1495  TetR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000123966  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  25.64 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3984  transcriptional regulator, TetR family protein  23.6 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0160  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4844  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 252 aa  49.3  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 223 aa  49.7  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 193 aa  48.9  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0219  regulatory protein, TetR  30.49 
 
 		 211 aa  48.9  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 216 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 216 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 216 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5881  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 197 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752924 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1679  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 185 aa  48.1  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>