More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0900 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0900  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
193 aa  391  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308807  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3430  transcriptional regulator, TetR family  55.21 
 
 
195 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0716  TetR family transcriptional regulator  51.04 
 
 
195 aa  196  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0815  TetR family transcriptional regulator  50.26 
 
 
196 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.642279  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3305  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 
195 aa  194  7e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3254  TetR family transcriptional regulator  49.74 
 
 
224 aa  191  6e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1617  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
202 aa  190  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0133761 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2260  TetR family transcriptional regulator  50.26 
 
 
214 aa  188  5e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0561114  normal  0.813784 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5345  TetR family transcriptional regulator  47.64 
 
 
198 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.922777  normal  0.179588 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1186  transcriptional regulator, TetR family  48.44 
 
 
206 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3326  TetR family transcriptional regulator  48.44 
 
 
207 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3182  TetR family transcriptional regulator  48.44 
 
 
207 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3183  TetR family transcriptional regulator  48.44 
 
 
207 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2793  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 
214 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4357  regulatory protein TetR  50.26 
 
 
201 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4399  transcriptional regulator, TetR family  48.69 
 
 
200 aa  177  8e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3494  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 
210 aa  176  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4180  transcriptional regulator, TetR family  49.23 
 
 
204 aa  176  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0804485  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1495  TetR family transcriptional regulator  48.35 
 
 
204 aa  175  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000123966  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1348  TetR family transcriptional regulator  48.97 
 
 
217 aa  175  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.054525 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1072  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 
206 aa  175  5e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000136093  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1901  TetR family transcriptional regulator  45.03 
 
 
201 aa  174  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.665453  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1076  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 
206 aa  174  9e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3046  TetR family transcriptional regulator  48.97 
 
 
199 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5198  transcriptional regulator, TetR family  46.28 
 
 
193 aa  172  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1144  TetR family transcriptional regulator  46.35 
 
 
206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00178929  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5165  transcriptional regulator, TetR family  44.27 
 
 
194 aa  171  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.707616 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3140  TetR family transcriptional regulator  48.96 
 
 
197 aa  166  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137738  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3078  regulatory protein, TetR  44.68 
 
 
203 aa  165  5e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.745436  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4123  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
204 aa  158  5e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4571  transcriptional regulator, TetR family  44.79 
 
 
199 aa  154  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1620  TetR family transcriptional regulator  45.26 
 
 
205 aa  149  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135802  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4065  transcriptional regulator, TetR family  48.17 
 
 
195 aa  146  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3984  transcriptional regulator, TetR family protein  40.96 
 
 
211 aa  145  5e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1491  transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 
210 aa  138  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00556415 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2295  TetR family transcriptional regulator  42.54 
 
 
204 aa  138  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1289  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 
211 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1327  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
211 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000128792 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2431  TetR family transcriptional regulator  42.54 
 
 
204 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547738  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1312  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
211 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000673566 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01107  predicted DNA-binding transcriptional regulator  40.31 
 
 
210 aa  136  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1234  TetR family transcriptional regulator  40.31 
 
 
236 aa  136  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01115  hypothetical protein  40.31 
 
 
210 aa  136  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1972  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 
211 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.134426  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1233  TetR family transcriptional regulator  40.31 
 
 
236 aa  135  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0636137  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2156  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
211 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000133556 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2212  transcriptional regulator, TetR family  40.31 
 
 
236 aa  136  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2490  TetR family transcriptional regulator  40.31 
 
 
210 aa  136  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000804693 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2779  transcriptional regulator, TetR family  40.41 
 
 
200 aa  135  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192265  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2536  transcriptional regulator, TetR family  40.31 
 
 
210 aa  135  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.018218  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2015  TetR family transcriptional regulator  40.31 
 
 
210 aa  135  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000283926 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1626  TetR family transcriptional regulator  39 
 
 
211 aa  134  8e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3927  TetR family transcriptional regulator  42.78 
 
 
208 aa  132  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.375374  normal  0.0268365 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26140  putative transcriptional regulator  44.27 
 
 
196 aa  130  9e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287141  normal  0.149256 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0493  TetR family transcriptional regulator  42.71 
 
 
206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5712  TetR family transcriptional regulator  41.44 
 
 
204 aa  129  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5542  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 
194 aa  128  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.789571  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1087  TetR family transcriptional regulator  38.54 
 
 
222 aa  129  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00014413  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1774  TetR family transcriptional regulator  40.88 
 
 
207 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2386  TetR family transcriptional regulator  40.88 
 
 
207 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1394  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 
214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8807  putative transcriptional regulator, TetR family  37.82 
 
 
211 aa  125  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3676  TetR family transcriptional regulator  39.27 
 
 
207 aa  120  9e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.508637  decreased coverage  0.00105541 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3330  transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 
219 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2298  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 
219 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3093  TetR family transcriptional regulator  38.83 
 
 
201 aa  119  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0252517 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0833  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
182 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0851  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
182 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.45674  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5842  TetR family transcriptional regulator  36.98 
 
 
188 aa  119  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25935  normal  0.516433 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3140  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
221 aa  117  9e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.263348  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0851  TetR family transcriptional regulator  36.6 
 
 
182 aa  117  9e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.780744  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3244  transcriptional regulator, TetR family  39.18 
 
 
221 aa  117  9e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3310  transcriptional regulator, TetR family  39.27 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0639272  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2545  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2227  TetR family transcriptional regulator  37.17 
 
 
209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0904  TetR family transcriptional regulator  41.53 
 
 
211 aa  115  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0824382  normal  0.0227277 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0960  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
219 aa  115  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.115896  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0120  transcriptional regulator, TetR family  37.95 
 
 
227 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.555065  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3418  regulatory protein TetR  40.41 
 
 
222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  0.510685 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5116  TetR family transcriptional regulator  34.2 
 
 
207 aa  110  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  35.6 
 
 
192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5169  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 
205 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148925  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1681  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 
198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2765  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 
196 aa  108  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.829891 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5750  transcriptional regulator, TetR family  36.65 
 
 
193 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0412881  normal 
 
 
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NC_009972  Haur_3137  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 
211 aa  108  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009667  Oant_0796  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 
203 aa  107  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.091153  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_3069  transcriptional regulator, TetR family  36.5 
 
 
208 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0746648  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 
218 aa  107  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013947  Snas_0160  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 
193 aa  106  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_2391  TetR family transcriptional regulator  37.95 
 
 
188 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640544  normal  0.528893 
 
 
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NC_011894  Mnod_7468  transcriptional regulator, TetR family  38.66 
 
 
218 aa  105  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.23471  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_2927  regulatory protein, TetR  35.35 
 
 
208 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260742  normal 
 
 
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NC_008463  PA14_32500  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 
204 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275577  normal  0.254114 
 
 
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NC_012850  Rleg_1253  transcriptional regulator, TetR family  36.32 
 
 
210 aa  104  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0477994 
 
 
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NC_009656  PSPA7_2754  hypothetical protein  37.31 
 
 
204 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.575763  n/a   
 
 
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NC_009952  Dshi_1874  putative regulatory protein  40.88 
 
 
198 aa  103  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885441  normal  0.710734 
 
 
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NC_009052  Sbal_0620  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
210 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
193 aa  102  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 
193 aa  102  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0397499 
 
 
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