More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4260 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 192 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  63.54 
 
 		 193 aa  251  6e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  61.14 
 
 		 193 aa  239  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0160  transcriptional regulator, TetR family  55.73 
 
 		 193 aa  212  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4302  transcriptional regulator, TetR family  40.84 
 
 		 192 aa  150  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985761  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4925  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 193 aa  141  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 194 aa  137  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 218 aa  135  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0716  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0418191  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  36.79 
 
 		 193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 193 aa  125  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 205 aa  125  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3433  TetR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 193 aa  124  9e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.389542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3305  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 195 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 206 aa  122  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 198 aa  121  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 222 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3000  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 193 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000368141  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 196 aa  118  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 216 aa  115  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1578  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3430  transcriptional regulator, TetR family  36.98 
 
 		 195 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 207 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 213 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0534  TetR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5182  TetR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000128547  normal  0.266544 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 212 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0481  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6285  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 198 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6453  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6688  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0530  hypothetical protein  36.11 
 
 		 198 aa  111  5e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2864  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 203 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.037684 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5717  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1395  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1418  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0900  TetR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308807  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 193 aa  109  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2964  transcriptional regulator, TetR family  35.43 
 
 		 195 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0240167  normal  0.157932 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2985  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000207551  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000004  transcriptional regulator  32.81 
 
 		 191 aa  108  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5165  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 194 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.707616 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05594  transcriptional regulator  32.81 
 
 		 191 aa  108  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2694  TetR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 203 aa  108  6e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357406 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3554  transcriptional regulator, TetR family  36.98 
 
 		 217 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2260  TetR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 214 aa  107  8.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0561114  normal  0.813784 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1977  transcriptional regulator, TetR family  32.78 
 
 		 193 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3078  regulatory protein, TetR  32.49 
 
 		 203 aa  106  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.745436  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2692  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 193 aa  105  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.504761 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1076  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1089  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 190 aa  105  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.631868 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1253  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0477994 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2762  TetR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 203 aa  105  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3494  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 210 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0145  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 202 aa  103  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.437687  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2606  transcriptional regulator, TetR family  32.4 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1379  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5345  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.922777  normal  0.179588 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5198  transcriptional regulator, TetR family  34.39 
 
 		 193 aa  102  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5500  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161362  decreased coverage  0.000153945 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3410  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2793  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 214 aa  102  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1032  TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 208 aa  102  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 219 aa  101  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2789  transcriptional regulator  32.12 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 198 aa  101  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3182  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 207 aa  101  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1186  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 206 aa  101  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3326  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 207 aa  101  7e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3183  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 207 aa  101  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0716  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 195 aa  101  8e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4399  transcriptional regulator, TetR family  35.98 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1144  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00178929  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01107  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.28 
 
 		 210 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 204 aa  99.8  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1072  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 206 aa  99.8  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000136093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0944  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 193 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2490  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 210 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000804693 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01115  hypothetical protein  32.28 
 
 		 210 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2536  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 210 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.018218  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1233  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 236 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0636137  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1234  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 236 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2212  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 236 aa  99.4  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1491  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 210 aa  99  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556415 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2210  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 185 aa  99  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1626  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 211 aa  99  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011773  BCAH820_3345  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 191 aa  98.6  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_010506  Swoo_4056  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 193 aa  98.6  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009832  Spro_1394  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 214 aa  98.2  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010335  Caul_5116  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 207 aa  98.6  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_1478  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 188 aa  98.2  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.182244  normal  1 
 
 
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NC_008061  Bcen_4420  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 201 aa  98.2  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_3947  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 201 aa  98.2  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
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NC_008228  Patl_4123  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 204 aa  97.8  9e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_1348  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 217 aa  97.8  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.054525 
 
 
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