More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5182 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0534  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 196 aa  403  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5182  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 196 aa  403  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000128547  normal  0.266544 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  38.54 
 
 		 192 aa  128  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3000  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 193 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000368141  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2985  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 193 aa  123  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000207551  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 207 aa  122  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1977  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 193 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 218 aa  120  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 194 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 		 198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 197 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 219 aa  111  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5058  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 195 aa  109  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 193 aa  109  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0504608 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 216 aa  108  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5717  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 156 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 193 aa  108  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2892  TetR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 194 aa  108  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 212 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1578  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2694  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 203 aa  105  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357406 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 204 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2762  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 203 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2408  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 192 aa  103  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1395  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2864  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 203 aa  102  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.037684 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1418  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 196 aa  101  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 204 aa  101  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0160  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 193 aa  99.8  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2964  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 195 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0240167  normal  0.157932 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6698  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 193 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6374  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 194 aa  99  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4925  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 193 aa  99  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0716  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 215 aa  98.2  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0418191  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1179  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 198 aa  97.8  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288888  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2210  TetR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 185 aa  97.8  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 198 aa  97.8  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 		 198 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 222 aa  97.4  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2431  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 204 aa  97.1  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547738  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5330  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 188 aa  97.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.733819 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4302  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 192 aa  97.1  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985761  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1379  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 196 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25370  transcriptional regulator  38.71 
 
 		 204 aa  95.9  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.422708  normal  0.650807 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3430  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 195 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 213 aa  95.5  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 213 aa  95.5  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05594  transcriptional regulator  31.43 
 
 		 191 aa  94.7  8e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4571  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 199 aa  94  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1348  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.054525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1032  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2295  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5345  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 198 aa  93.2  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.922777  normal  0.179588 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05760  Transcriptional regulatory protein, TetR family  32.46 
 
 		 195 aa  93.6  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.466087  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 213 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0716  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 195 aa  92.4  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4420  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 201 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3947  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 201 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3753  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.02252 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3345  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 191 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0110  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 193 aa  92.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2721  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 193 aa  92  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.236108  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2789  transcriptional regulator  31.61 
 
 		 206 aa  91.7  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1228  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 193 aa  91.3  7e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1292  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 193 aa  91.3  7e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000004  transcriptional regulator  30.29 
 
 		 191 aa  91.3  9e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3254  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 224 aa  91.3  9e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1396  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 193 aa  90.9  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2355  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 201 aa  90.9  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.552854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8807  putative transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0530  hypothetical protein  32.14 
 
 		 198 aa  89.7  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2903  transcriptional regulator of TetR family protein  30.16 
 
 		 196 aa  90.5  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.453644  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1620  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 205 aa  89.4  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1326  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 193 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0115046 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1901  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 201 aa  89.4  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.665453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1229  regulatory protein, TetR  28.27 
 
 		 235 aa  89.4  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2692  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 193 aa  89.4  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.504761 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1157  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 193 aa  89.4  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4144  TetR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 188 aa  89.7  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.188303  normal  0.0621662 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4056  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 193 aa  89.4  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4262  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 226 aa  89  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3672  TetR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 188 aa  89  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 206 aa  89  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3062  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 193 aa  89  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000497782 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3046  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 199 aa  88.6  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0097  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 188 aa  88.2  6e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1774  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 207 aa  88.6  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2386  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 207 aa  88.6  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0252  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 194 aa  88.2  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.867584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0969  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 202 aa  88.2  8e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021423 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3101  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 212 aa  88.2  8e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3554  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 217 aa  87.8  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3305  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 195 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0419  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 217 aa  87.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00785696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>