More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3753 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3753  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 207 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.02252 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1032  TetR family transcriptional regulator  51.5 
 
 		 208 aa  199  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4420  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 201 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3947  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 201 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2789  transcriptional regulator  47 
 
 		 206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2762  transcriptional regulator, TetR family  42.23 
 
 		 207 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.598965  normal  0.857853 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2210  TetR family transcriptional regulator  48.37 
 
 		 185 aa  164  9e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3581  TetR family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 185 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0145  TetR family transcriptional regulator  43.85 
 
 		 202 aa  153  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.437687  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2508  transcriptional regulator, TetR family  47.87 
 
 		 206 aa  147  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 216 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2606  transcriptional regulator, TetR family  36.72 
 
 		 209 aa  112  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1348  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 217 aa  105  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.054525 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1620  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 205 aa  105  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  34.9 
 
 		 193 aa  105  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 193 aa  103  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6453  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 198 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3046  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 199 aa  104  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6285  TetR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 198 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6688  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 198 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 219 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4180  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0804485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3430  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 195 aa  99.8  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1901  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 201 aa  99  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.665453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 192 aa  99  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 196 aa  99  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3137  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 211 aa  98.2  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4357  regulatory protein TetR  34.04 
 
 		 201 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0534  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 196 aa  97.4  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5182  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 196 aa  97.4  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000128547  normal  0.266544 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 198 aa  97.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1253  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0477994 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0160  transcriptional regulator, TetR family  33.92 
 
 		 193 aa  96.3  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1626  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 211 aa  94.7  8e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0716  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 195 aa  93.6  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1617  TetR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 202 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0133761 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1491  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 210 aa  92  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556415 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1179  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 198 aa  91.7  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288888  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 213 aa  91.3  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 213 aa  91.3  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 193 aa  91.7  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 213 aa  91.7  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3305  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 195 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08040  transcriptional regulator  34.34 
 
 		 203 aa  91.3  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01107  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.93 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2536  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.018218  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2212  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 236 aa  90.1  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1234  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 236 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2490  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000804693 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01115  hypothetical protein  28.93 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 195 aa  90.1  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0960  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 219 aa  90.1  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.115896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4925  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 193 aa  90.1  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1327  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 211 aa  89.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128792 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1312  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 211 aa  89.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000673566 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1289  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 211 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1972  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 211 aa  88.6  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.134426  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1233  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 236 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0636137  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2156  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 211 aa  88.2  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000133556 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5542  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 194 aa  88.2  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.789571  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 200 aa  87.8  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0504608 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0900  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 193 aa  86.7  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308807  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4399  transcriptional regulator, TetR family  34.87 
 
 		 200 aa  86.3  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3310  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 205 aa  86.3  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0639272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3927  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 208 aa  86.3  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.375374  normal  0.0268365 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2985  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 193 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000207551  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3676  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 207 aa  85.1  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.508637  decreased coverage  0.00105541 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3140  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 197 aa  85.1  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137738  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2015  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 210 aa  85.1  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283926 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1977  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 193 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2779  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 200 aa  84.7  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 193 aa  84.7  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1087  TetR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 222 aa  84.7  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00014413  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05760  Transcriptional regulatory protein, TetR family  32.28 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.466087  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3000  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 193 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000368141  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 197 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0796  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.091153  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 198 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
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NC_008048  Sala_2260  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0561114  normal  0.813784 
 
 
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NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 198 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_4047  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.866362  normal  0.450827 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_1106  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.527206 
 
 
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NC_011365  Gdia_2298  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
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NC_007778  RPB_4262  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013132  Cpin_4302  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985761  normal  0.0925574 
 
 
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NC_008391  Bamb_3672  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6904  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_8807  putative transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A5712  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 204 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 194 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_4571  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 199 aa  80.9  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
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NC_008463  PA14_26140  putative transcriptional regulator  32.47 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287141  normal  0.149256 
 
 
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NC_009338  Mflv_0944  TetR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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