More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2508 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2508  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 206 aa  401  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2762  transcriptional regulator, TetR family  67.32 
 
 		 207 aa  270  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.598965  normal  0.857853 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2789  transcriptional regulator  61.34 
 
 		 206 aa  237  8e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1032  TetR family transcriptional regulator  57.44 
 
 		 208 aa  217  7e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4420  TetR family transcriptional regulator  48.17 
 
 		 201 aa  171  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3947  TetR family transcriptional regulator  48.17 
 
 		 201 aa  171  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2210  TetR family transcriptional regulator  55.87 
 
 		 185 aa  171  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0145  TetR family transcriptional regulator  49.73 
 
 		 202 aa  167  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.437687  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3753  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.02252 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3581  TetR family transcriptional regulator  46.45 
 
 		 185 aa  154  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 205 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  36.13 
 
 		 212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 216 aa  115  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  35.98 
 
 		 192 aa  111  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2606  transcriptional regulator, TetR family  36.16 
 
 		 209 aa  109  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 200 aa  105  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0504608 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 222 aa  104  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 193 aa  101  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0716  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 195 aa  99  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2985  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000207551  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1626  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 211 aa  95.1  7e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6285  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 198 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6453  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 198 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6688  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 198 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0120  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 227 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.555065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  35.43 
 
 		 197 aa  92.8  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3000  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 193 aa  92.8  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000368141  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 193 aa  92.8  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1491  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 210 aa  91.7  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556415 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1977  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 193 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 207 aa  91.3  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2156  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 211 aa  90.5  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000133556 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0620  TetR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2779  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 200 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3137  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4123  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 204 aa  90.5  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01107  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.1 
 
 		 210 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2536  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.018218  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01115  hypothetical protein  30.1 
 
 		 210 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0419  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 217 aa  89.7  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00785696  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2490  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 210 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000804693 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1234  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 236 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2212  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 236 aa  89.4  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1312  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 211 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000673566 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1289  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 211 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1901  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 201 aa  89  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.665453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1327  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 211 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128792 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2015  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 210 aa  89  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283926 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1972  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 211 aa  88.6  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.134426  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1233  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 236 aa  88.2  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0636137  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 206 aa  87.8  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 194 aa  87.8  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3305  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 195 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4571  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  33.56 
 
 		 193 aa  87.8  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 213 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4180  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 204 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0804485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 213 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 196 aa  86.3  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3046  TetR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 199 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3430  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 195 aa  85.9  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1774  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 207 aa  85.5  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2298  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 219 aa  85.5  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2386  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 207 aa  85.5  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1076  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 206 aa  85.1  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2431  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 204 aa  84.7  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547738  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1348  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.054525 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3643  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256948 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2295  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 204 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3984  transcriptional regulator, TetR family protein  34.1 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1620  TetR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4357  regulatory protein TetR  36 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2892  TetR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1144  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00178929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3078  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.745436  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3310  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0639272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1617  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0133761 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2260  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0561114  normal  0.813784 
 
 
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NC_011773  BCAH820_3345  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 191 aa  82  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0900  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308807  normal  0.448888 
 
 
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NC_012560  Avin_05760  Transcriptional regulatory protein, TetR family  33.51 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.466087  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_26140  putative transcriptional regulator  33.5 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287141  normal  0.149256 
 
 
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NC_004347  SO_3494  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_1072  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000136093  normal  1 
 
 
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NC_012857  Rpic12D_3535  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 191 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_5542  transcriptional regulator, TetR family  41.59 
 
 		 194 aa  80.9  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.789571  normal  0.111085 
 
 
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NC_010678  Rpic_4611  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 371 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010084  Bmul_0904  TetR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0824382  normal  0.0227277 
 
 
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NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
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NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007948  Bpro_0534  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00215663  normal  1 
 
 
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NC_007949  Bpro_5182  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000128547  normal  0.266544 
 
 
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NC_010002  Daci_3927  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.375374  normal  0.0268365 
 
 
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NC_009675  Anae109_3254  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008048  Sala_2692  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.504761 
 
 
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NC_009972  Haur_1495  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000123966  n/a   
 
 
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