More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2762 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2762  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 207 aa  413  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.598965  normal  0.857853 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2508  transcriptional regulator, TetR family  67.32 
 
 		 206 aa  232  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2789  transcriptional regulator  57.22 
 
 		 206 aa  223  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1032  TetR family transcriptional regulator  53.61 
 
 		 208 aa  206  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4420  TetR family transcriptional regulator  45.55 
 
 		 201 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3947  TetR family transcriptional regulator  45.55 
 
 		 201 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2210  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3753  TetR family transcriptional regulator  42.23 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.02252 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3581  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 185 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0145  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 202 aa  142  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.437687  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 205 aa  132  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 216 aa  108  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6453  TetR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 198 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6688  TetR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 198 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6285  TetR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 198 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2606  transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4262  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 226 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2779  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 200 aa  92.8  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0716  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 195 aa  92.8  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 200 aa  90.9  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0504608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 192 aa  90.1  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 193 aa  89.7  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0120  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 227 aa  89  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.555065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 193 aa  88.6  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2156  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 211 aa  88.2  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000133556 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05760  Transcriptional regulatory protein, TetR family  31.94 
 
 		 195 aa  86.7  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.466087  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1972  transcriptional regulator, TetR family  25.98 
 
 		 211 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.134426  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1312  TetR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 211 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000673566 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1327  TetR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 211 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128792 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1289  transcriptional regulator, TetR family  25.98 
 
 		 211 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2260  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 214 aa  86.3  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0561114  normal  0.813784 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2295  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 204 aa  85.9  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5542  transcriptional regulator, TetR family  31.12 
 
 		 194 aa  85.9  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.789571  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2892  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 194 aa  85.9  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2355  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 201 aa  85.5  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.552854 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3137  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 211 aa  85.5  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1491  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 210 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556415 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 197 aa  85.1  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3345  transcriptional regulator, TetR family  24.72 
 
 		 191 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1348  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.054525 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0481  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01107  predicted DNA-binding transcriptional regulator  25.85 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2536  transcriptional regulator, TetR family  25.85 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.018218  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1495  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000123966  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2490  TetR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000804693 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4571  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01115  hypothetical protein  25.85 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1874  putative regulatory protein  31.34 
 
 		 198 aa  83.6  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885441  normal  0.710734 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1626  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2431  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547738  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1234  TetR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2212  transcriptional regulator, TetR family  25.85 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5165  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.707616 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4047  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.866362  normal  0.450827 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1901  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.665453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2015  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283926 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2298  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3418  regulatory protein TetR  42.15 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  0.510685 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08040  transcriptional regulator  32.24 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5712  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0900  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308807  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1620  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26140  putative transcriptional regulator  32.82 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287141  normal  0.149256 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1233  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 236 aa  81.6  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0636137  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4180  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 204 aa  81.3  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0804485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4123  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 204 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7468  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.23471  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0904  TetR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0824382  normal  0.0227277 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3430  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 195 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0959  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.783426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4357  regulatory protein TetR  31.84 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3046  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1617  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0133761 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4302  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985761  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1774  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2386  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0839  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3305  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 194 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0534  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5182  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000128547  normal  0.266544 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1087  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00014413  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5345  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.922777  normal  0.179588 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3310  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0639272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3676  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.508637  decreased coverage  0.00105541 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  24.61 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0110  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5198  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1977  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>