More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0839 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0839  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 203 aa  407  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0959  transcriptional regulator, TetR family  92.54 
 
 		 219 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.783426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4262  TetR family transcriptional regulator  49.24 
 
 		 226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4047  TetR family transcriptional regulator  48.22 
 
 		 205 aa  191  7e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.866362  normal  0.450827 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6901  TetR family transcriptional regulator  47.26 
 
 		 229 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165859 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2727  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 213 aa  121  6e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0989177  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3676  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 207 aa  115  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.508637  decreased coverage  0.00105541 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3494  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 210 aa  112  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1076  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 206 aa  111  9e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3254  TetR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4123  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1072  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 206 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000136093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1144  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 206 aa  108  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00178929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2793  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 214 aa  105  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0716  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 195 aa  104  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3182  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1186  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3183  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3326  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1495  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000123966  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0178  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 203 aa  102  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2227  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 209 aa  101  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 213 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0815  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 196 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.642279  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0960  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 219 aa  100  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.115896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3078  regulatory protein, TetR  30.26 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.745436  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1253  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 210 aa  98.6  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0477994 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2298  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 219 aa  98.6  6e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2260  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 214 aa  98.6  6e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0561114  normal  0.813784 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0716  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 215 aa  97.8  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0418191  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4399  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 200 aa  97.1  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0620  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0796  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 203 aa  96.7  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.091153  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 218 aa  97.1  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 198 aa  95.5  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2431  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 204 aa  94.7  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547738  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0120  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 227 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.555065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 198 aa  94  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5165  transcriptional regulator, TetR family  34.54 
 
 		 194 aa  94  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.707616 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2295  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 204 aa  93.2  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2906  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 205 aa  93.2  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0722139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1774  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 207 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2386  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 207 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5198  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 193 aa  92  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3137  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 211 aa  91.7  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1087  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 222 aa  91.7  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00014413  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3330  transcriptional regulator, TetR family  34.01 
 
 		 219 aa  91.3  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5712  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 204 aa  91.3  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2156  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000133556 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1617  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0133761 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1289  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3140  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.263348  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0293  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 203 aa  90.1  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000668888 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1327  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 211 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128792 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2545  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 194 aa  90.1  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1312  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 211 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000673566 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26140  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287141  normal  0.149256 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 200 aa  89.7  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0504608 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1972  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 211 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.134426  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1394  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 214 aa  89  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0481  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  89  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 219 aa  89  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0900  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 193 aa  88.2  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308807  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3046  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2015  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283926 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3430  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 195 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4571  transcriptional regulator, TetR family  31.44 
 
 		 199 aa  86.3  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1348  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 217 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.054525 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3244  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 221 aa  85.9  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1491  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 210 aa  85.1  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556415 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5345  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 198 aa  84.7  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.922777  normal  0.179588 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4065  transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 		 195 aa  85.1  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 204 aa  84.7  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3418  regulatory protein TetR  36.04 
 
 		 222 aa  84.7  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  0.510685 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01107  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.47 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2536  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.018218  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1234  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 236 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0944  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 193 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_2490  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000804693 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_1233  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 236 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0636137  n/a   
 
 
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NC_012892  B21_01115  hypothetical protein  29.47 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E2212  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 236 aa  83.6  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009952  Dshi_1874  putative regulatory protein  30.54 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885441  normal  0.710734 
 
 
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NC_007778  RPB_3305  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
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NC_010338  Caul_0493  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  30.96 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010002  Daci_3927  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.375374  normal  0.0268365 
 
 
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NC_013947  Snas_5542  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.789571  normal  0.111085 
 
 
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NC_008726  Mvan_5842  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25935  normal  0.516433 
 
 
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NC_010725  Mpop_4180  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0804485  normal  1 
 
 
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NC_009436  Ent638_1626  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_3310  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0639272  normal  1 
 
 
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NC_012912  Dd1591_3137  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011894  Mnod_7468  transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 		 218 aa  81.6  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.23471  n/a   
 
 
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NC_010172  Mext_4357  regulatory protein TetR  34.34 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008062  Bcen_6453  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 198 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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