More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5463 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 212 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  93.06 
 
 		 216 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 205 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1032  TetR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 208 aa  139  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  39.88 
 
 		 218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2606  transcriptional regulator, TetR family  37.71 
 
 		 209 aa  138  7e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6285  TetR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 198 aa  128  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6453  TetR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 198 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6688  TetR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 198 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 222 aa  125  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4420  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 201 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3947  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 201 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2789  transcriptional regulator  36.41 
 
 		 206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  35.18 
 
 		 219 aa  117  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05760  Transcriptional regulatory protein, TetR family  35.75 
 
 		 195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.466087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 194 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 204 aa  112  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2762  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.598965  normal  0.857853 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3753  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 207 aa  108  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.02252 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 197 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 204 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2210  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 185 aa  108  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 200 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0504608 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2508  transcriptional regulator, TetR family  38.51 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0419  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 217 aa  105  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00785696  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0481  TetR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 211 aa  105  6e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3581  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 185 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0160  transcriptional regulator, TetR family  34.5 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0145  TetR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 202 aa  102  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.437687  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4302  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 192 aa  101  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985761  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1626  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1491  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 210 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556415 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0178  TetR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 203 aa  98.6  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01107  predicted DNA-binding transcriptional regulator  34.5 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01115  hypothetical protein  34.5 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0534  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 196 aa  97.4  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5182  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 196 aa  97.4  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000128547  normal  0.266544 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2490  TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000804693 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2212  transcriptional regulator, TetR family  34.5 
 
 		 236 aa  96.7  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1234  TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 236 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2015  TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 210 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283926 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2536  transcriptional regulator, TetR family  34.5 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.018218  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0716  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 215 aa  96.3  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0418191  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2692  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 193 aa  95.9  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.504761 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1977  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 193 aa  95.5  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1233  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 236 aa  95.1  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0636137  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5717  transcriptional regulator, TetR family  33.79 
 
 		 156 aa  95.5  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6698  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 193 aa  95.5  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3000  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 193 aa  94.7  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000368141  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 198 aa  94.7  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1253  transcriptional regulator, TetR family  32.55 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0477994 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2892  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 194 aa  94.7  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 198 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2985  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 193 aa  94  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000207551  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 198 aa  92.8  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 206 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0493  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0117598 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2156  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000133556 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4925  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 193 aa  91.3  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0815  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 196 aa  90.1  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.642279  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1972  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 211 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.134426  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4047  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 205 aa  90.5  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.866362  normal  0.450827 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1327  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128792 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1289  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1312  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000673566 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4262  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 226 aa  89.4  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2431  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 204 aa  89  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547738  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2295  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 204 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4180  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 204 aa  87  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0804485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3046  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 199 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1874  putative regulatory protein  31.77 
 
 		 198 aa  85.9  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885441  normal  0.710734 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3137  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 211 aa  85.9  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2727  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 213 aa  85.1  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0989177  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2631  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 197 aa  85.1  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0870793 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4357  regulatory protein TetR  30.89 
 
 		 201 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5712  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 204 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3554  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 217 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3672  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 188 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1620  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3254  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_0959  transcriptional regulator, TetR family  40.18 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.783426  normal  1 
 
 
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NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  26.18 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
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NC_010511  M446_1348  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.054525 
 
 
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NC_009719  Plav_0716  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
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NC_009484  Acry_3101  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009338  Mflv_0944  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009664  Krad_2189  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_0110  transcriptional regulator, TetR family  42.97 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011071  Smal_2765  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.829891 
 
 
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NC_011004  Rpal_3430  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
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