More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5338 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  97.65 
 
 		 213 aa  418  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  86.67 
 
 		 206 aa  343  1e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0944  TetR family transcriptional regulator  80.83 
 
 		 193 aa  296  2e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0419  transcriptional regulator, TetR family  45.41 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00785696  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0493  transcriptional regulator, TetR family  40.31 
 
 		 222 aa  135  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0117598 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2189  transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 202 aa  124  8.000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0481  TetR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 192 aa  116  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1874  putative regulatory protein  34.55 
 
 		 198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885441  normal  0.710734 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 193 aa  111  8.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 218 aa  111  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 196 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 205 aa  106  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  34.87 
 
 		 219 aa  105  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 198 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 207 aa  104  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3078  regulatory protein, TetR  30.61 
 
 		 203 aa  103  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.745436  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4420  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3947  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3975  transcriptional regulator, TetR family  36.93 
 
 		 203 aa  102  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  33.83 
 
 		 193 aa  101  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0504608 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0839  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 194 aa  99.4  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0959  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 219 aa  99.8  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.783426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0815  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 196 aa  99.4  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.642279  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 204 aa  95.9  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25370  transcriptional regulator  37.28 
 
 		 204 aa  95.9  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.422708  normal  0.650807 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1144  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 206 aa  95.1  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00178929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05760  Transcriptional regulatory protein, TetR family  30.89 
 
 		 195 aa  94.7  8e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.466087  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 197 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5165  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 194 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.707616 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2727  transcriptional regulator, TetR family  45.3 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0989177  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1179  transcriptional regulator, TetR family  32.66 
 
 		 198 aa  93.6  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288888  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5500  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 190 aa  94  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161362  decreased coverage  0.000153945 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  34.1 
 
 		 212 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1076  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 198 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3494  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 210 aa  93.2  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2793  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 214 aa  93.2  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 216 aa  92  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3581  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 185 aa  92  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 204 aa  92  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1072  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 206 aa  91.7  7e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000136093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4302  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 192 aa  91.7  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985761  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 198 aa  91.7  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2892  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 194 aa  91.7  9e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 222 aa  90.5  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1032  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 208 aa  91.3  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2332  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 193 aa  91.3  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.950158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 193 aa  91.3  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 193 aa  90.5  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5116  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3182  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 207 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4262  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0534  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 196 aa  90.5  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5182  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 196 aa  90.5  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000128547  normal  0.266544 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1186  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3183  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 207 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3326  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 207 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 193 aa  89  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4047  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 205 aa  88.2  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.866362  normal  0.450827 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2789  transcriptional regulator  31.41 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3433  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 193 aa  87.8  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.389542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08040  transcriptional regulator  31.82 
 
 		 203 aa  87.4  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4123  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 204 aa  87.8  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0716  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0418191  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3676  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 207 aa  86.7  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.508637  decreased coverage  0.00105541 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6453  TetR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 198 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6688  TetR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 198 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6285  TetR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 198 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4925  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 193 aa  86.3  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1253  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 210 aa  86.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0477994 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3305  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 195 aa  85.9  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3140  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 221 aa  85.5  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.263348  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3984  transcriptional regulator, TetR family protein  27.08 
 
 		 211 aa  85.1  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2598  hypothetical protein  43.1 
 
 		 235 aa  85.1  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3753  TetR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 207 aa  84.7  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.02252 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1578  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 203 aa  84.7  9e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1495  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 204 aa  84.7  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000123966  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0716  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 195 aa  84.7  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
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NC_013037  Dfer_3410  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 192 aa  84.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2606  transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0160  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0097  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013132  Cpin_3573  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0355911  normal  0.084172 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3670  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.411004  n/a   
 
 
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NC_009441  Fjoh_3212  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008577  Shewana3_2864  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.037684 
 
 
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NC_011365  Gdia_2298  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
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NC_007912  Sde_0293  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000668888 
 
 
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NC_008044  TM1040_0319  TetR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008048  Sala_2260  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0561114  normal  0.813784 
 
 
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NC_006274  BCZK2985  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000207551  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_2210  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.540344 
 
 
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NC_009456  VC0395_0238  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 191 aa  82  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008044  TM1040_0178  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  1 
 
 
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