64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2598 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2598  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  454  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0493  transcriptional regulator, TetR family  53.23 
 
 		 222 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0117598 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0419  transcriptional regulator, TetR family  44.53 
 
 		 217 aa  99.8  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00785696  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 213 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 213 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 213 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0944  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2189  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4925  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  36.61 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0716  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0418191  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4679  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 193 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.136213 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5717  transcriptional regulator, TetR family  28.46 
 
 		 156 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2727  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 213 aa  52.4  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0989177  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 218 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2692  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 193 aa  50.1  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.504761 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6374  transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 194 aa  50.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4262  TetR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 226 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 193 aa  48.9  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4611  transcriptional regulator, TetR family  32.21 
 
 		 371 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25370  transcriptional regulator  33.65 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.422708  normal  0.650807 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3494  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 194 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3212  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 193 aa  47.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3975  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 204 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1076  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4047  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 205 aa  46.2  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.866362  normal  0.450827 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2793  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 214 aa  46.2  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3182  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 207 aa  45.8  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3183  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 207 aa  45.8  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3326  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 207 aa  45.8  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0959  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 219 aa  45.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.783426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 198 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3430  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 195 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1186  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 206 aa  45.4  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 193 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 192 aa  45.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0252  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 194 aa  45.4  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.867584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3535  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4302  transcriptional regulator, TetR family  25.74 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985761  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0839  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 203 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2386  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 207 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4399  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 204 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1774  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 207 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0530  hypothetical protein  26.89 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 198 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1874  putative regulatory protein  29.47 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885441  normal  0.710734 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0948  TetR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 191 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.627177  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1681  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 198 aa  43.5  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1013  TetR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 191 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0178  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 203 aa  43.5  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4123  TetR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 204 aa  43.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2391  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 188 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640544  normal  0.528893 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1072  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000136093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1181  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 191 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000215765  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05594  transcriptional regulator  23.57 
 
 		 191 aa  42.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1144  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 206 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00178929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5165  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 194 aa  42  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.707616 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000004  transcriptional regulator  23.57 
 
 		 191 aa  42  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
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