More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3212 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3212  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
193 aa  395  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6698  transcriptional regulator, TetR family  64.25 
 
 
193 aa  255  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6374  transcriptional regulator, TetR family  38.66 
 
 
194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0252  TetR family transcriptional regulator  38.86 
 
 
194 aa  147  7e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.867584  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 
197 aa  92.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
222 aa  92  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 
193 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 
206 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1076  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 
206 aa  88.6  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 
192 aa  86.7  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 
193 aa  86.3  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 
196 aa  84.7  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 
213 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 
213 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 
213 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2793  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 
214 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1032  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 
208 aa  83.6  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2189  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 
202 aa  82.8  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3345  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 
191 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05760  Transcriptional regulatory protein, TetR family  28.87 
 
 
195 aa  82  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.466087  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 
216 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0493  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 
222 aa  81.6  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0117598 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1186  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 
206 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3182  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
207 aa  81.3  0.000000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3326  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
207 aa  81.3  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3183  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
207 aa  81.3  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3494  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 
210 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1072  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 
206 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000136093  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  26.18 
 
 
193 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 
207 aa  79  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0716  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 
215 aa  79  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0418191  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1144  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 
206 aa  79  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00178929  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 
200 aa  78.6  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0504608 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2156  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
211 aa  78.2  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000133556 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3078  regulatory protein, TetR  30.59 
 
 
203 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.745436  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1253  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 
210 aa  77.8  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0477994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 
193 aa  76.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 
205 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1289  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 
211 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1327  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
211 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000128792 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1312  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
211 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000673566 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2892  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 
194 aa  76.3  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 
218 aa  76.3  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1972  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 
211 aa  75.9  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.134426  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2762  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 
203 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4262  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
226 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4302  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985761  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2727  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 
213 aa  74.3  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0989177  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1681  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 
198 aa  73.6  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1626  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2694  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 
203 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00357406 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 
193 aa  73.6  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12083  transcriptional regulator, TetR family protein  29.78 
 
 
187 aa  72.8  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1395  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 
202 aa  72.4  0.000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0418723  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0534  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00215663  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5182  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000128547  normal  0.266544 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3000  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 
193 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000368141  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2903  transcriptional regulator of TetR family protein  29.7 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.453644  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0948  TetR family transcriptional regulator  27.39 
 
 
191 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.627177  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1181  transcriptional regulator, TetR family  27.39 
 
 
191 aa  72  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000215765  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1013  TetR family transcriptional regulator  27.39 
 
 
191 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2864  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 
203 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.037684 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4123  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 
204 aa  71.2  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1234  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
236 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2212  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 
236 aa  70.5  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1977  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 
193 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01107  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.3 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2536  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.018218  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 
204 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0178  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4925  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
193 aa  70.5  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2490  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000804693 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  27.51 
 
 
198 aa  69.7  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01115  hypothetical protein  30.3 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0419  transcriptional regulator, TetR family  23.44 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00785696  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3975  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1491  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00556415 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3410  transcriptional regulator, TetR family  24.08 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208492  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  28.06 
 
 
198 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1233  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
236 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0636137  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0293  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 
203 aa  68.9  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000668888 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2015  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000283926 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0944  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 
193 aa  68.2  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 
198 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4679  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 
193 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.136213 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0969  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 
202 aa  67.8  0.00000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021423 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3101  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 
212 aa  67.4  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2985  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 
193 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000207551  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 
204 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0481  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 
211 aa  67.8  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1578  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 
203 aa  67  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 
212 aa  66.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4047  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 
205 aa  67  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.866362  normal  0.450827 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5717  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  32.9 
 
 
192 aa  66.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6901  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
229 aa  65.9  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.165859 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0143  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>