More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0319 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_0319  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
194 aa  389  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0481  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 
211 aa  100  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  38.51 
 
 
198 aa  99  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1874  putative regulatory protein  38.34 
 
 
198 aa  97.8  8e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885441  normal  0.710734 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 
194 aa  96.3  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 
198 aa  95.5  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4399  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 
200 aa  94.4  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  32.07 
 
 
198 aa  94  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3494  TetR family transcriptional regulator  38.42 
 
 
210 aa  93.2  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  36.87 
 
 
218 aa  93.6  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1186  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 
206 aa  91.7  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0944  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
193 aa  91.7  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3326  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
207 aa  91.7  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3182  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
207 aa  91.7  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3183  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
207 aa  91.7  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1076  TetR family transcriptional regulator  36.72 
 
 
206 aa  91.3  8e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3305  TetR family transcriptional regulator  35.6 
 
 
195 aa  91.3  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 
206 aa  91.3  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 
192 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1144  TetR family transcriptional regulator  34.87 
 
 
206 aa  90.5  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00178929  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4302  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 
192 aa  89.4  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985761  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 
207 aa  89  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1072  TetR family transcriptional regulator  36.16 
 
 
206 aa  89  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000136093  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 
193 aa  88.6  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 
197 aa  88.6  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1495  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
204 aa  87.8  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000123966  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2793  TetR family transcriptional regulator  36.16 
 
 
214 aa  87.8  9e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05760  Transcriptional regulatory protein, TetR family  37.44 
 
 
195 aa  86.7  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.466087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 
193 aa  85.5  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0900  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
193 aa  85.1  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308807  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 
219 aa  84  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4925  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 
193 aa  83.6  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  35.54 
 
 
213 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  35.54 
 
 
213 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1617  TetR family transcriptional regulator  35.86 
 
 
202 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0133761 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  35.54 
 
 
213 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1681  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 
198 aa  82  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0815  TetR family transcriptional regulator  34.1 
 
 
196 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.642279  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3254  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
224 aa  81.6  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1179  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 
198 aa  80.5  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288888  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4047  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.866362  normal  0.450827 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5198  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 
193 aa  79.7  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6901  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
229 aa  80.1  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.165859 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3046  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
199 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2227  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 
209 aa  80.1  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 
193 aa  79.3  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 
196 aa  79.3  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3078  regulatory protein, TetR  31.28 
 
 
203 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.745436  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 
200 aa  79.3  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0504608 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0160  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 
193 aa  79.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4262  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 
226 aa  79  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4420  TetR family transcriptional regulator  35.67 
 
 
201 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3984  transcriptional regulator, TetR family protein  31.82 
 
 
211 aa  79  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3947  TetR family transcriptional regulator  35.67 
 
 
201 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5165  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.707616 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2260  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
214 aa  78.6  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0561114  normal  0.813784 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1348  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
217 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.054525 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0716  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 
195 aa  78.2  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4123  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
204 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5542  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 
194 aa  77  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.789571  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3430  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 
195 aa  77  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0960  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 
219 aa  77.8  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.115896  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4180  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 
204 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0804485  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4357  regulatory protein TetR  34.55 
 
 
201 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1229  regulatory protein, TetR  33.7 
 
 
235 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2189  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 
202 aa  76.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3330  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 
219 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2295  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 
204 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0716  TetR family transcriptional regulator  32.92 
 
 
215 aa  76.3  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0418191  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2431  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
204 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547738  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0106  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 
192 aa  75.9  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.431172  normal  0.200565 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5842  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25935  normal  0.516433 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 
204 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2156  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 
211 aa  75.5  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000133556 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5169  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 
205 aa  75.1  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148925  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1289  transcriptional regulator, TetR family  28.82 
 
 
211 aa  75.1  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1312  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 
211 aa  75.1  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000673566 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8807  putative transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 
211 aa  74.7  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1327  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 
211 aa  75.1  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000128792 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1972  transcriptional regulator, TetR family  28.82 
 
 
211 aa  74.7  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.134426  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0178  TetR family transcriptional regulator  35.25 
 
 
203 aa  74.7  0.0000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
193 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5712  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
204 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 
193 aa  73.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 
222 aa  73.2  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1087  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 
222 aa  73.2  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00014413  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1774  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
207 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3927  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
208 aa  73.6  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.375374  normal  0.0268365 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26140  putative transcriptional regulator  43.75 
 
 
196 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287141  normal  0.149256 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2386  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
207 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_012853  Rleg_5750  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 
193 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0412881  normal 
 
 
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NC_010338  Caul_0493  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
206 aa  73.2  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009664  Krad_0493  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 
222 aa  73.6  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0117598 
 
 
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NC_011071  Smal_2765  transcriptional regulator, TetR family  35.43 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.829891 
 
 
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NC_013093  Amir_4065  transcriptional regulator, TetR family  34.5 
 
 
195 aa  73.2  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_0419  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
217 aa  72.8  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00785696  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_0851  TetR family transcriptional regulator  35.67 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.780744  normal 
 
 
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NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 
204 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009485  BBta_5345  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 
198 aa  72.4  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.922777  normal  0.179588 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
205 aa  72  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
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