More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3975 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3975  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 203 aa  400  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 206 aa  104  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 213 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0419  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 217 aa  94  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00785696  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0944  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 193 aa  91.3  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0493  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 222 aa  91.3  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0117598 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6698  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 193 aa  87.8  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4262  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3573  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0355911  normal  0.084172 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1179  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 198 aa  80.1  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288888  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6901  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165859 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08040  transcriptional regulator  30.73 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1076  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0815  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.642279  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2892  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 194 aa  74.7  0.0000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5165  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 194 aa  74.7  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.707616 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2298  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05760  Transcriptional regulatory protein, TetR family  32.29 
 
 		 195 aa  74.3  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.466087  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1072  TetR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000136093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2793  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1144  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00178929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5842  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25935  normal  0.516433 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3494  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 210 aa  72  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013440  Hoch_5198  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 193 aa  72  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 212 aa  72  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1186  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3326  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3182  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2227  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1617  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0133761 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3183  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1578  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  24.14 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3212  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1901  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.665453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1874  putative regulatory protein  32.07 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885441  normal  0.710734 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5712  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2864  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.037684 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0960  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.115896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0716  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0504608 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3672  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0120  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 227 aa  67.8  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.555065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0481  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0534  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5182  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000128547  normal  0.266544 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1774  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0252  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.867584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4399  transcriptional regulator, TetR family  31.73 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2386  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4144  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.188303  normal  0.0621662 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2631  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0870793 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0178  TetR family transcriptional regulator  55.93 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3137  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0839  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4047  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.866362  normal  0.450827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4804  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.120851  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2545  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2295  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2260  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0561114  normal  0.813784 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1396  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4925  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0319  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0833  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0851  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.45674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3330  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2431  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547738  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3554  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2727  transcriptional regulator, TetR family  52.31 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0989177  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0900  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308807  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3140  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.263348  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1348  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.054525 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2189  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3078  regulatory protein, TetR  28.72 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.745436  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4123  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3418  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  0.510685 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0959  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.783426  normal  1 
 
 
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NC_011145  AnaeK_3244  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008322  Shewmr7_2762  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
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NC_011894  Mnod_7468  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.23471  n/a   
 
 
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NC_010505  Mrad2831_3046  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008345  Sfri_1088  transcriptional regulator, TetR family protein  27.72 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008345  Sfri_3984  transcriptional regulator, TetR family protein  30.89 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008786  Veis_1032  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009675  Anae109_3254  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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