More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_05760 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_05760  Transcriptional regulatory protein, TetR family  100 
 
 		 195 aa  391  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.466087  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  37.89 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 216 aa  122  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 212 aa  122  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 194 aa  121  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 193 aa  118  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4925  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4047  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.866362  normal  0.450827 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1032  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 208 aa  113  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  36.13 
 
 		 193 aa  111  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2156  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000133556 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4571  transcriptional regulator, TetR family  34.03 
 
 		 199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2606  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1312  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000673566 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1289  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1972  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 211 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.134426  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1327  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128792 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0120  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 227 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.555065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 218 aa  108  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5542  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 194 aa  106  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.789571  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 		 204 aa  106  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2210  TetR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3554  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 217 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1394  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 214 aa  105  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 205 aa  105  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2892  TetR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 194 aa  105  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 204 aa  105  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5712  TetR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 204 aa  105  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1348  TetR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 217 aa  104  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.054525 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 193 aa  104  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1774  TetR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1626  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 211 aa  103  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2386  TetR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6698  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 193 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4262  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01107  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.8 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2536  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.018218  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01115  hypothetical protein  32.8 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 198 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1491  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556415 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2490  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000804693 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5058  transcriptional regulator, TetR family  35.98 
 
 		 195 aa  102  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1234  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 236 aa  102  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3244  transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 		 221 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2212  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 236 aa  102  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 198 aa  102  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0481  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 211 aa  102  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 213 aa  101  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3078  regulatory protein, TetR  35.9 
 
 		 203 aa  101  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.745436  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3330  transcriptional regulator, TetR family  37.56 
 
 		 219 aa  101  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 213 aa  101  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 213 aa  101  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1681  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 198 aa  101  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1233  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 236 aa  101  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0636137  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2015  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 210 aa  101  8e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283926 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26140  putative transcriptional regulator  38.22 
 
 		 196 aa  101  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287141  normal  0.149256 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3418  regulatory protein TetR  36.98 
 
 		 222 aa  100  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  0.510685 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4420  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3137  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3947  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3046  TetR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2295  TetR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 204 aa  99.8  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 193 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3611  transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 184 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00310361  normal  0.0495451 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0504608 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2431  TetR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547738  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4180  transcriptional regulator, TetR family  35.57 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0804485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4357  regulatory protein TetR  35.05 
 
 		 201 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3140  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 221 aa  98.6  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.263348  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 193 aa  99  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1087  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 222 aa  99  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00014413  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 193 aa  98.6  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5198  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 193 aa  98.6  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2985  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 193 aa  98.2  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000207551  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3000  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 193 aa  98.2  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000368141  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0716  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 195 aa  98.2  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6374  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 194 aa  97.8  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 192 aa  97.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3140  TetR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 197 aa  97.8  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137738  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1617  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 202 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0133761 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3494  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0716  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 215 aa  96.7  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0418191  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3345  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 191 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2408  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 192 aa  96.7  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3093  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 201 aa  96.3  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0252517 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2227  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 209 aa  96.3  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3927  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 208 aa  95.9  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.375374  normal  0.0268365 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1620  TetR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 205 aa  95.9  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4399  transcriptional regulator, TetR family  37.24 
 
 		 200 aa  95.5  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2779  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 200 aa  95.5  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2692  TetR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 193 aa  95.5  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.504761 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0948  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 191 aa  95.1  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.627177  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 207 aa  95.1  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1013  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 191 aa  95.1  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2332  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 193 aa  95.1  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.950158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4056  TetR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 193 aa  95.1  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2793  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 214 aa  94.7  7e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1977  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 193 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>