More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2955 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
193 aa  394  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4925  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 
193 aa  123  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4302  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 
192 aa  123  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985761  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
196 aa  118  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3535  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 
191 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  37.64 
 
 
194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  39.88 
 
 
222 aa  115  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 
219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4611  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 
371 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  37.71 
 
 
193 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3326  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
207 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3183  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
207 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3182  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
207 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1186  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 
206 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2793  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5717  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 
156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 
193 aa  109  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 
192 aa  109  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3494  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
210 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 
200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0504608 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1032  TetR family transcriptional regulator  34.2 
 
 
208 aa  107  8.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 
193 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0716  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 
195 aa  105  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0900  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 
193 aa  103  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308807  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0160  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 
193 aa  103  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8807  putative transcriptional regulator, TetR family  36.32 
 
 
211 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 
198 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1072  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
206 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000136093  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1076  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 
206 aa  103  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0716  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 
215 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0418191  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1144  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 
206 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00178929  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3078  regulatory protein, TetR  31.11 
 
 
203 aa  102  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.745436  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2260  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 
214 aa  102  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0561114  normal  0.813784 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1617  TetR family transcriptional regulator  34.24 
 
 
202 aa  102  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0133761 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6698  transcriptional regulator, TetR family  34.39 
 
 
193 aa  102  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 
198 aa  102  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  34.01 
 
 
197 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5198  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 
193 aa  100  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3430  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 
195 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2692  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 
193 aa  99.8  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.504761 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2227  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 
209 aa  98.6  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4571  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 
199 aa  99  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4399  transcriptional regulator, TetR family  34.9 
 
 
200 aa  99  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2985  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 
193 aa  98.6  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000207551  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
207 aa  98.6  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3305  TetR family transcriptional regulator  33.89 
 
 
195 aa  98.2  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3000  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 
193 aa  97.8  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000368141  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0815  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
196 aa  97.1  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.642279  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4180  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 
204 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0804485  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 
204 aa  97.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5165  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 
194 aa  96.7  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.707616 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3254  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
224 aa  96.3  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 
205 aa  96.3  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1181  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 
191 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000215765  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4357  regulatory protein TetR  31.75 
 
 
201 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0948  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 
191 aa  95.9  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.627177  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1013  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 
191 aa  95.9  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  34.46 
 
 
204 aa  95.9  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6453  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
198 aa  95.5  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6688  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
198 aa  95.5  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1348  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 
217 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.054525 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6285  TetR family transcriptional regulator  34.87 
 
 
198 aa  95.5  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42646  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3140  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 
197 aa  95.1  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137738  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4123  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 
204 aa  94.7  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3345  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 
191 aa  95.1  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1901  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 
201 aa  94.7  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.665453  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05760  Transcriptional regulatory protein, TetR family  34.2 
 
 
195 aa  94.7  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.466087  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2431  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
204 aa  94.4  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547738  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1977  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 
193 aa  94.4  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1289  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 
211 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1327  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 
211 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000128792 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1312  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 
211 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000673566 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 
198 aa  93.6  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1972  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 
211 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.134426  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3310  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 
205 aa  93.2  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0639272  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2156  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 
211 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000133556 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1626  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
211 aa  92.8  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3046  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
199 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5542  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 
194 aa  92.4  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.789571  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5712  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
204 aa  91.7  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3140  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
221 aa  91.7  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.263348  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3212  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
193 aa  91.3  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1394  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
214 aa  91.3  8e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1774  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
207 aa  91.3  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2386  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
207 aa  91.3  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1495  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
204 aa  90.1  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000123966  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3927  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 
208 aa  89.7  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.375374  normal  0.0268365 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2892  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
194 aa  89.4  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0252  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
194 aa  89  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.867584  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2295  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
204 aa  89  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008061  Bcen_4420  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
201 aa  88.6  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_3947  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
201 aa  88.6  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.354968 
 
 
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NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 
193 aa  88.2  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3984  transcriptional regulator, TetR family protein  30.66 
 
 
211 aa  88.2  7e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010623  Bphy_4679  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
193 aa  88.2  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.136213 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2789  transcriptional regulator  30.93 
 
 
206 aa  87.8  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008578  Acel_0481  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 
211 aa  87.8  9e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011369  Rleg2_2906  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 
205 aa  87.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0722139  normal 
 
 
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NC_007778  RPB_4262  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
226 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
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