More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0716 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_0716  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  441  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0418191  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4302  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 192 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985761  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  39.38 
 
 		 193 aa  142  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 193 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4925  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 193 aa  131  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 204 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 193 aa  125  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 196 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3410  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 		 192 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 193 aa  118  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 193 aa  117  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2692  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 193 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.504761 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5717  transcriptional regulator, TetR family  36.91 
 
 		 156 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 198 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4047  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.866362  normal  0.450827 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3000  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 193 aa  109  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000368141  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 222 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 205 aa  108  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 207 aa  108  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 219 aa  108  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4262  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 226 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 		 198 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1977  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 193 aa  105  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 198 aa  105  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0948  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 191 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.627177  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1013  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 191 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3345  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 191 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5500  transcriptional regulator, TetR family  31.89 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161362  decreased coverage  0.000153945 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0160  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 193 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1181  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 191 aa  102  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000215765  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 194 aa  102  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2985  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 193 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000207551  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6901  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 229 aa  99.8  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165859 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3573  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 195 aa  99  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0355911  normal  0.084172 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2332  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 193 aa  98.2  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.950158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0839  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 203 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1901  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 201 aa  96.3  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.665453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 216 aa  96.3  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 212 aa  96.3  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0481  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 211 aa  96.3  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5198  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 193 aa  95.9  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3643  TetR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 193 aa  95.9  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256948 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05760  Transcriptional regulatory protein, TetR family  30.69 
 
 		 195 aa  95.5  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.466087  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0959  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 219 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.783426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3078  regulatory protein, TetR  30.32 
 
 		 203 aa  92.8  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.745436  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 200 aa  92.8  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0504608 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2729  TetR family transcriptional regulator  37.64 
 
 		 196 aa  92.8  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0815  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 196 aa  92.8  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.642279  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3554  transcriptional regulator, TetR family  35.18 
 
 		 217 aa  92.4  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0534  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 196 aa  91.3  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5182  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 196 aa  91.3  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000128547  normal  0.266544 
 
 
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NC_014210  Ndas_1179  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 198 aa  91.3  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288888  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1874  putative regulatory protein  29.69 
 
 		 198 aa  90.1  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885441  normal  0.710734 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0419  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 217 aa  90.1  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00785696  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2355  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 201 aa  90.5  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.552854 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4056  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 193 aa  90.5  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4420  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 201 aa  89  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3947  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 201 aa  89  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 213 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2015  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 210 aa  89  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283926 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3101  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 212 aa  88.6  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1234  TetR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 236 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2212  transcriptional regulator, TetR family  26.27 
 
 		 236 aa  87.4  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1089  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 190 aa  87.4  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.631868 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01107  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.5 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2490  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000804693 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01115  hypothetical protein  26.5 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2694  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 203 aa  87  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357406 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4180  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 204 aa  87  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0804485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4357  regulatory protein TetR  32.65 
 
 		 201 aa  87  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2408  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 192 aa  86.7  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2536  transcriptional regulator, TetR family  26.5 
 
 		 210 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.018218  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1491  transcriptional regulator, TetR family  26.5 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556415 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3581  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 185 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1076  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 206 aa  86.7  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1233  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 236 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0636137  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1578  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 203 aa  85.9  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3433  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 193 aa  85.5  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.389542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2762  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 203 aa  85.5  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2606  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 209 aa  85.5  6e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4065  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 195 aa  85.5  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3099  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 192 aa  85.1  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.806996 
 
 
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NC_009436  Ent638_1626  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 211 aa  85.1  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_004347  SO_3494  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007802  Jann_2631  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 197 aa  84.7  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0870793 
 
 
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NC_011205  SeD_A2156  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000133556 
 
 
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NC_010511  M446_1348  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.054525 
 
 
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NC_009338  Mflv_0944  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011094  SeSA_A1289  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011083  SeHA_C1327  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128792 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A1312  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000673566 
 
 
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NC_009052  Sbal_1395  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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