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for query gene Ssed_3643 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3643  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 193 aa  400  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256948 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4056  TetR family transcriptional regulator  90.67 
 
 		 193 aa  366  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1157  TetR family transcriptional regulator  65.62 
 
 		 193 aa  271  3e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3393  TetR family transcriptional regulator  65.62 
 
 		 193 aa  271  6e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1158  TetR family transcriptional regulator  65.62 
 
 		 193 aa  270  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1228  TetR family transcriptional regulator  65.1 
 
 		 193 aa  268  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1396  TetR family transcriptional regulator  65.45 
 
 		 193 aa  268  4e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2721  TetR family transcriptional regulator  64.06 
 
 		 193 aa  267  8e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.236108  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1248  TetR family transcriptional regulator  63.02 
 
 		 193 aa  258  3e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3062  transcriptional regulator, TetR family  62.5 
 
 		 193 aa  257  6e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000497782 
 
 
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NC_009665  Shew185_1292  TetR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 193 aa  257  6e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1326  TetR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 193 aa  257  8e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0115046 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3099  TetR family transcriptional regulator  61.98 
 
 		 192 aa  241  7e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.806996 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2408  TetR family transcriptional regulator  60.1 
 
 		 192 aa  235  3e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1229  regulatory protein, TetR  58.12 
 
 		 235 aa  234  4e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1088  transcriptional regulator, TetR family protein  58.01 
 
 		 198 aa  226  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0238  TetR family transcriptional regulator  55.68 
 
 		 191 aa  201  8e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 194 aa  97.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4302  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 192 aa  96.7  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985761  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 193 aa  96.7  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0716  TetR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0418191  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  31.89 
 
 		 192 aa  95.5  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1395  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 202 aa  95.1  6e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0418723  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 193 aa  94.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2903  transcriptional regulator of TetR family protein  28.34 
 
 		 196 aa  93.6  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.453644  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 193 aa  90.5  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 219 aa  90.1  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0143  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 202 aa  90.1  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05760  Transcriptional regulatory protein, TetR family  35.12 
 
 		 195 aa  87.8  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.466087  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4262  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 226 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1841  transcriptional regulator, TetR family protein  29.34 
 
 		 195 aa  86.3  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 218 aa  86.3  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0969  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 202 aa  85.9  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021423 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3670  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 197 aa  85.5  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.411004  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  31.89 
 
 		 197 aa  85.1  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0224  transcriptional regulator, TetR-family  27.81 
 
 		 192 aa  85.1  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 193 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1032  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3410  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0534  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5182  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000128547  normal  0.266544 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0160  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4123  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3046  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0948  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 191 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.627177  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3000  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000368141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1013  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 191 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008345  Sfri_2816  transcriptional regulator, TetR family protein  31.21 
 
 		 188 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4925  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 193 aa  80.9  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3704  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.21281 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1977  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1181  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000215765  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1626  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1394  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3345  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2606  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 209 aa  77.8  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2210  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2985  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000207551  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4357  regulatory protein TetR  31.15 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4180  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0804485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2789  transcriptional regulator  28.42 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4420  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3927  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.375374  normal  0.0268365 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3947  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2545  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3305  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 195 aa  74.7  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0959  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.783426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0944  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 193 aa  74.3  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3430  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3093  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0252517 
 
 
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NC_007643  Rru_A0145  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.437687  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1106  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.527206 
 
 
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NC_011138  MADE_02226  transcriptional regulator, TetR family protein  22.99 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.972925  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_1348  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.054525 
 
 
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NC_013131  Caci_4571  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
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NC_011205  SeD_A2156  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000133556 
 
 
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NC_013132  Cpin_5500  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161362  decreased coverage  0.000153945 
 
 
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NC_012850  Rleg_1253  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0477994 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A1312  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000673566 
 
 
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NC_011083  SeHA_C1327  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128792 
 
 
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NC_007912  Sde_0293  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000668888 
 
 
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NC_012850  Rleg_2762  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.598965  normal  0.857853 
 
 
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NC_011094  SeSA_A1289  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_2508  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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