More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2969 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  447  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  56.19 
 
 		 196 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  55.96 
 
 		 197 aa  210  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  51.38 
 
 		 204 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  49.46 
 
 		 204 aa  192  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  49.73 
 
 		 207 aa  188  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 200 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0504608 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2973  regulatory protein, TetR  91.01 
 
 		 102 aa  165  5e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2355  TetR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.552854 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3000  TetR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 193 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000368141  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2985  TetR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 193 aa  128  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000207551  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1977  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 216 aa  126  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  37.77 
 
 		 212 aa  125  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  38.34 
 
 		 193 aa  125  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 205 aa  122  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  34.9 
 
 		 192 aa  119  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 194 aa  118  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3101  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 198 aa  116  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  39.88 
 
 		 193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 193 aa  111  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  36.79 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4925  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 193 aa  109  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0716  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 215 aa  108  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0418191  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4302  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 192 aa  108  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985761  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4420  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 201 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3947  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 201 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2606  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3430  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 195 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1032  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 208 aa  105  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4679  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 193 aa  105  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.136213 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5717  transcriptional regulator, TetR family  38.52 
 
 		 156 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3305  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 195 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2692  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 193 aa  102  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.504761 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2789  transcriptional regulator  32.49 
 
 		 206 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3345  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6698  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 193 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 206 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 193 aa  98.6  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 218 aa  97.8  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3581  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 185 aa  95.1  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0534  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 196 aa  94.7  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5182  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 196 aa  94.7  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000128547  normal  0.266544 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3535  transcriptional regulator, TetR family  34.5 
 
 		 191 aa  93.2  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4611  transcriptional regulator, TetR family  34.5 
 
 		 371 aa  92.8  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0530  hypothetical protein  30.16 
 
 		 198 aa  92.4  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009441  Fjoh_3212  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 193 aa  92  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0716  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 195 aa  91.7  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1181  transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 		 191 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000215765  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5500  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 190 aa  91.3  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161362  decreased coverage  0.000153945 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3254  TetR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 224 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2332  transcriptional regulator, TetR family  31.77 
 
 		 193 aa  90.9  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.950158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 213 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 213 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2508  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0948  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 191 aa  90.1  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.627177  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1013  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 191 aa  90.1  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26140  putative transcriptional regulator  34.04 
 
 		 196 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287141  normal  0.149256 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2892  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 194 aa  89  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0110  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 193 aa  89  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05760  Transcriptional regulatory protein, TetR family  32.18 
 
 		 195 aa  89  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.466087  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2762  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.598965  normal  0.857853 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1179  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 198 aa  87.8  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288888  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5712  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 204 aa  87  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2295  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 204 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3069  transcriptional regulator, TetR family  33.97 
 
 		 208 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0746648  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0145  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 202 aa  86.3  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.437687  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0900  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 193 aa  86.7  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308807  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0252  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 194 aa  86.7  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.867584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2694  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 203 aa  86.7  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357406 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2431  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 204 aa  86.3  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547738  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1626  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12083  transcriptional regulator, TetR family protein  26.23 
 
 		 187 aa  86.3  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2779  transcriptional regulator, TetR family  39.09 
 
 		 200 aa  85.9  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0481  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 211 aa  86.3  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1874  putative regulatory protein  31.79 
 
 		 198 aa  85.5  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885441  normal  0.710734 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4047  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 205 aa  85.9  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.866362  normal  0.450827 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3137  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 211 aa  85.5  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000004  transcriptional regulator  29.21 
 
 		 191 aa  85.5  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3433  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 193 aa  84.7  9e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.389542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1774  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2386  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4065  transcriptional regulator, TetR family  36.63 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007802  Jann_2631  TetR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0870793 
 
 
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NC_011149  SeAg_B1972  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.134426  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_0493  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0117598 
 
 
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NC_011205  SeD_A2156  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000133556 
 
 
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NC_007953  Bxe_C0815  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.642279  normal  0.93191 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A1312  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000673566 
 
 
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NC_011094  SeSA_A1289  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009832  Spro_2545  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011083  SeHA_C1327  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128792 
 
 
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NC_009485  BBta_5345  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.922777  normal  0.179588 
 
 
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NC_013521  Sked_33680  transcriptional regulator  40 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.737103  normal  1 
 
 
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