More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1179 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1179  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 198 aa  404  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288888  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  46.46 
 
 		 198 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08040  transcriptional regulator  41.92 
 
 		 203 aa  155  3e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  43.88 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 194 aa  115  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4302  transcriptional regulator, TetR family  32.49 
 
 		 192 aa  111  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985761  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 196 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 193 aa  104  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3430  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 195 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 197 aa  102  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5198  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 193 aa  101  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4925  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 193 aa  99  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0534  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 196 aa  97.8  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5182  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 196 aa  97.8  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000128547  normal  0.266544 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0833  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 182 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0851  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 182 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.45674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2892  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 194 aa  95.9  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 		 192 aa  95.1  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3305  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 195 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 213 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1327  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 211 aa  92.8  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128792 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1312  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 211 aa  92.8  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000673566 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 193 aa  92.4  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3046  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 199 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 193 aa  92.4  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1972  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 211 aa  92  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.134426  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4399  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 200 aa  92  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 205 aa  91.7  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 200 aa  91.7  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0504608 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1289  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 211 aa  91.3  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0851  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 182 aa  91.3  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.780744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4357  regulatory protein TetR  33.67 
 
 		 201 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 207 aa  90.5  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1253  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0477994 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0716  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 215 aa  91.3  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0418191  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5842  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 188 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25935  normal  0.516433 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 198 aa  90.9  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2298  transcriptional regulator, TetR family  35.5 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2156  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 211 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000133556 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0815  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 196 aa  90.1  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.642279  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 218 aa  89.7  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1106  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 210 aa  89.4  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4180  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 204 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0804485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2189  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 202 aa  89  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3254  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 224 aa  88.6  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 193 aa  89  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3753  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 207 aa  88.6  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.02252 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1348  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 217 aa  88.6  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.054525 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0716  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 195 aa  88.2  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1626  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 211 aa  87.8  9e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3310  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 205 aa  87.8  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0639272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 		 198 aa  87.8  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 206 aa  87.8  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01107  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.57 
 
 		 210 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2536  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 210 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.018218  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5345  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 198 aa  87.8  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.922777  normal  0.179588 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2212  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 236 aa  87.4  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01115  hypothetical protein  28.57 
 
 		 210 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2490  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 210 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000804693 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1234  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 236 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1491  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556415 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1233  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 236 aa  87  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0636137  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 193 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3140  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 221 aa  86.3  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.263348  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4123  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 204 aa  86.3  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1617  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 202 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0133761 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1901  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 201 aa  85.9  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.665453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2015  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 210 aa  85.5  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283926 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2431  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 204 aa  85.5  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547738  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2332  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 193 aa  85.5  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.950158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2260  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 214 aa  85.1  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0561114  normal  0.813784 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3137  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 211 aa  85.1  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1874  putative regulatory protein  29.15 
 
 		 198 aa  84.7  8e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885441  normal  0.710734 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0252  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 194 aa  84.3  9e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.867584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5542  transcriptional regulator, TetR family  31.77 
 
 		 194 aa  84.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.789571  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5712  TetR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 204 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal  1 
 
 
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NC_007954  Sden_3078  regulatory protein, TetR  28.5 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.745436  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_1394  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013132  Cpin_5500  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 190 aa  84.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161362  decreased coverage  0.000153945 
 
 
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NC_013093  Amir_0419  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00785696  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_0900  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 193 aa  83.6  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308807  normal  0.448888 
 
 
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NC_009621  Smed_5330  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.733819 
 
 
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NC_010551  BamMC406_2295  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_004347  SO_3494  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_3345  transcriptional regulator, TetR family  24.29 
 
 		 191 aa  82  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_007908  Rfer_3140  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137738  n/a   
 
 
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NC_008061  Bcen_4420  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_0160  transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008543  Bcen2424_3947  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
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NC_012850  Rleg_0120  transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.555065  normal  1 
 
 
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NC_009338  Mflv_0944  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 193 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008044  TM1040_0319  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012560  Avin_05760  Transcriptional regulatory protein, TetR family  30.61 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.466087  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B1977  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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