More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4501 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 198 aa  391  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1179  transcriptional regulator, TetR family  46.46 
 
 		 198 aa  194  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288888  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  51.02 
 
 		 219 aa  185  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08040  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 203 aa  142  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 196 aa  136  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4302  transcriptional regulator, TetR family  37.06 
 
 		 192 aa  126  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985761  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 193 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 194 aa  123  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 193 aa  122  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 197 aa  122  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 192 aa  121  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 193 aa  118  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 218 aa  118  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4925  TetR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 193 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 198 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 200 aa  114  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0504608 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1626  TetR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0534  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 196 aa  112  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5182  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 196 aa  112  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000128547  normal  0.266544 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2892  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 194 aa  112  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 193 aa  111  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0944  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01107  predicted DNA-binding transcriptional regulator  34.55 
 
 		 210 aa  108  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2490  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 210 aa  108  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000804693 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01115  hypothetical protein  34.55 
 
 		 210 aa  108  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1233  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 236 aa  108  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0636137  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1234  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 236 aa  108  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1491  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 210 aa  108  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556415 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2212  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 236 aa  108  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 206 aa  108  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2536  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 210 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.018218  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3410  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 192 aa  107  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2015  TetR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 210 aa  106  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283926 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1874  putative regulatory protein  35.86 
 
 		 198 aa  105  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885441  normal  0.710734 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2156  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000133556 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05760  Transcriptional regulatory protein, TetR family  36.36 
 
 		 195 aa  105  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.466087  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5500  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 190 aa  105  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161362  decreased coverage  0.000153945 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0716  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0418191  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1327  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 211 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128792 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5198  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 193 aa  105  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1289  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 211 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1312  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 211 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000673566 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1972  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 211 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.134426  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 213 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 213 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 213 aa  104  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1977  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 193 aa  104  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 193 aa  104  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3000  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 193 aa  104  9e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000368141  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2189  transcriptional regulator, TetR family  33.84 
 
 		 202 aa  103  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1901  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.665453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0833  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 182 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5165  transcriptional regulator, TetR family  36.55 
 
 		 194 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.707616 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0851  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 182 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.45674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 204 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2985  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 193 aa  101  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000207551  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 190 aa  100  9e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1032  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 208 aa  101  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4420  TetR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3947  TetR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4399  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 200 aa  99.8  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3672  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 188 aa  99.8  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4144  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 188 aa  99.4  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.188303  normal  0.0621662 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2332  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 193 aa  99.8  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.950158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2355  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 201 aa  99.4  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.552854 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0319  TetR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 194 aa  99  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4357  regulatory protein TetR  35.53 
 
 		 201 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4180  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 204 aa  97.8  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0804485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1348  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 217 aa  97.8  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.054525 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3554  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 217 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0851  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 182 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.780744  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0948  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 191 aa  95.5  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.627177  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1013  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 191 aa  95.5  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0900  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 193 aa  95.1  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308807  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1394  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 214 aa  94.7  8e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0716  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 195 aa  94.4  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3046  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 199 aa  94.4  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 193 aa  94  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5330  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 188 aa  94.4  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.733819 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5345  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 198 aa  94.4  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.922777  normal  0.179588 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1181  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 191 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000215765  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 216 aa  93.2  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2298  transcriptional regulator, TetR family  35.86 
 
 		 219 aa  92  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3305  TetR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 195 aa  91.7  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0493  transcriptional regulator, TetR family  33.84 
 
 		 222 aa  91.3  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0117598 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4262  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 226 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0481  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0252  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 194 aa  89.7  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.867584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5842  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 188 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25935  normal  0.516433 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3137  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_3581  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 185 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428867  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_3430  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 195 aa  89.4  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
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NC_010506  Swoo_4056  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 193 aa  89  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007953  Bxe_C0815  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 196 aa  89  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.642279  normal  0.93191 
 
 
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