More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0252 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0252  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 194 aa  391  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.867584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6374  transcriptional regulator, TetR family  42.49 
 
 		 194 aa  177  5.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6698  transcriptional regulator, TetR family  40.41 
 
 		 193 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3212  TetR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 193 aa  147  7e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 194 aa  101  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 197 aa  95.5  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 198 aa  89.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0481  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0493  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 222 aa  89  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0117598 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 193 aa  89  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2156  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 211 aa  87.8  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000133556 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1312  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000673566 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1327  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128792 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1289  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05760  Transcriptional regulatory protein, TetR family  29.02 
 
 		 195 aa  86.3  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.466087  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1972  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.134426  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 222 aa  86.7  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 193 aa  85.9  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5542  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 194 aa  85.9  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.789571  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4925  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 193 aa  84.7  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 193 aa  84.7  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 200 aa  84.7  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0504608 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1179  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 198 aa  84.3  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288888  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2892  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 194 aa  84.3  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0534  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5182  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000128547  normal  0.266544 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1253  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0477994 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1032  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  28.06 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3345  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4399  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5712  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  25.91 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1774  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2386  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4123  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01107  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.86 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5330  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.733819 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01115  hypothetical protein  30.86 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2490  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000804693 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12083  transcriptional regulator, TetR family protein  29.44 
 
 		 187 aa  77.8  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2015  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283926 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2212  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1495  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000123966  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1491  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556415 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2431  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547738  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  29.74 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1234  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1617  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0133761 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1681  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1626  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1478  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.182244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1076  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4302  transcriptional regulator, TetR family  28.36 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985761  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2545  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0716  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0418191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2536  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.018218  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4144  TetR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.188303  normal  0.0621662 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1233  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0636137  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2765  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.829891 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 207 aa  74.3  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 218 aa  74.3  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0110  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 193 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3078  regulatory protein, TetR  28.06 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.745436  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2295  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1072  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000136093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1106  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0948  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.627177  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1013  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1181  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000215765  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1901  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.665453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  25.51 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3672  TetR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5198  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3984  transcriptional regulator, TetR family protein  27.65 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3535  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009438  Sputcn32_2793  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1144  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 206 aa  72  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00178929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4571  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 199 aa  72  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
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NC_009675  Anae109_3254  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 224 aa  72  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010678  Rpic_4611  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 371 aa  71.6  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010623  Bphy_4679  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 193 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.136213 
 
 
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NC_008786  Veis_0960  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.115896  normal  1 
 
 
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NC_004347  SO_3494  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007908  Rfer_3140  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137738  n/a   
 
 
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NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal  1 
 
 
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NC_009719  Plav_0716  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_3554  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
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NC_009052  Sbal_3183  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009665  Shew185_3182  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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