More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4307 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  403  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0504608 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 207 aa  226  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  53.51 
 
 		 204 aa  206  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  54.14 
 
 		 204 aa  201  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  47.67 
 
 		 197 aa  192  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 196 aa  184  8e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 222 aa  182  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2985  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 193 aa  123  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000207551  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1977  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 193 aa  122  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2355  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 201 aa  121  7e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.552854 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3000  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 193 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000368141  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2892  TetR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 194 aa  118  7e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 198 aa  115  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 194 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 198 aa  114  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3345  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 191 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5717  transcriptional regulator, TetR family  40.97 
 
 		 156 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2692  TetR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 193 aa  111  8.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.504761 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4925  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  31.44 
 
 		 193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 216 aa  108  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0534  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 196 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5182  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 196 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000128547  normal  0.266544 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 193 aa  106  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4420  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 201 aa  104  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3947  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 201 aa  104  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1032  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 208 aa  103  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1874  putative regulatory protein  37.5 
 
 		 198 aa  102  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885441  normal  0.710734 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 193 aa  102  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2789  transcriptional regulator  35.9 
 
 		 206 aa  101  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1181  transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 		 191 aa  101  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000215765  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0948  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 191 aa  101  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.627177  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1013  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 191 aa  101  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 213 aa  99  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0944  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 193 aa  99  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0493  transcriptional regulator, TetR family  31.73 
 
 		 222 aa  97.8  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0117598 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 192 aa  96.3  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25370  transcriptional regulator  36 
 
 		 204 aa  96.3  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.422708  normal  0.650807 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2973  regulatory protein, TetR  46.67 
 
 		 102 aa  95.1  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26140  putative transcriptional regulator  35.03 
 
 		 196 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287141  normal  0.149256 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2227  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 209 aa  94  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2508  transcriptional regulator, TetR family  38.29 
 
 		 206 aa  94  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 218 aa  94  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0716  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 215 aa  92.8  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0418191  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3581  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 185 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5500  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 190 aa  91.7  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161362  decreased coverage  0.000153945 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1179  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 198 aa  91.7  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288888  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05760  Transcriptional regulatory protein, TetR family  32.11 
 
 		 195 aa  91.3  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.466087  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2762  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.598965  normal  0.857853 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 219 aa  90.5  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6901  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 229 aa  90.5  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165859 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0839  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 203 aa  89.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3305  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 195 aa  88.6  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4302  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 192 aa  89  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985761  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0959  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 219 aa  88.2  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.783426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08040  transcriptional regulator  37.91 
 
 		 203 aa  88.2  7e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3430  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 195 aa  88.2  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0620  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 210 aa  88.2  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3494  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 210 aa  87.8  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3410  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 192 aa  87.8  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3101  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4262  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 226 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4047  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.866362  normal  0.450827 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0178  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 203 aa  87  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 193 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2332  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 193 aa  87  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.950158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4123  TetR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 204 aa  86.3  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 193 aa  85.9  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0481  TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 211 aa  85.9  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1620  TetR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 205 aa  85.9  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1076  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 206 aa  85.5  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1617  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 202 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0133761 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2779  transcriptional regulator, TetR family  40.52 
 
 		 200 aa  85.1  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3078  regulatory protein, TetR  37.8 
 
 		 203 aa  84.7  8e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.745436  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0252  TetR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 194 aa  84.7  9e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.867584  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3069  transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0746648  n/a   
 
 
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NC_007953  Bxe_C0815  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 196 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.642279  normal  0.93191 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_1144  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00178929  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_4399  transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_6374  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009675  Anae109_3254  TetR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012857  Rpic12D_3535  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013441  Gbro_2181  regulatory protein TetR  32.91 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.852456  n/a   
 
 
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NC_008321  Shewmr4_2694  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357406 
 
 
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NC_008740  Maqu_0143  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_1901  TetR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.665453  normal  1 
 
 
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NC_010511  M446_3753  TetR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.02252 
 
 
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NC_013174  Jden_0106  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.431172  normal  0.200565 
 
 
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NC_013132  Cpin_3573  transcriptional regulator, TetR family  32.92 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0355911  normal  0.084172 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A5712  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_1072  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000136093  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_3554  transcriptional regulator, TetR family  38.21 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009485  BBta_2210  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.540344 
 
 
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