More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0481 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0481  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 211 aa  422  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 193 aa  121  7e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 213 aa  121  9e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 213 aa  121  9e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  40.44 
 
 		 193 aa  119  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 		 192 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4262  TetR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 216 aa  112  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0160  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  36.7 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4302  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 192 aa  108  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985761  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0716  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0418191  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6901  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165859 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0319  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 194 aa  99.4  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 204 aa  99.4  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4047  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 205 aa  99.4  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.866362  normal  0.450827 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2189  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 		 202 aa  99.4  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 193 aa  98.6  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 205 aa  98.2  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 204 aa  98.2  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4925  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 193 aa  97.4  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 194 aa  96.7  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05760  Transcriptional regulatory protein, TetR family  33.84 
 
 		 195 aa  96.7  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.466087  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0944  TetR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 193 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 219 aa  95.5  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2892  TetR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 194 aa  94.7  8e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2762  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 203 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2298  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 219 aa  94  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5712  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 204 aa  93.2  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 222 aa  93.2  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0252  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 194 aa  94  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.867584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2227  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 209 aa  94  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5500  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 190 aa  93.2  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161362  decreased coverage  0.000153945 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2864  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 203 aa  92.8  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.037684 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4399  transcriptional regulator, TetR family  34.22 
 
 		 200 aa  92.4  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1681  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 198 aa  92.4  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0530  hypothetical protein  30.05 
 
 		 198 aa  92.4  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0959  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 219 aa  92  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.783426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2694  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 203 aa  92  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357406 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2985  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 193 aa  91.7  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000207551  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 196 aa  91.7  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2606  transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 		 209 aa  91.7  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2332  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 193 aa  91.3  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.950158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 200 aa  90.9  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0504608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 198 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0839  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 203 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B1977  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 193 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 193 aa  90.5  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
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NC_012850  Rleg_2762  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.598965  normal  0.857853 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2545  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 194 aa  90.5  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000004  transcriptional regulator  30.3 
 
 		 191 aa  89.7  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3000  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 193 aa  89.4  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000368141  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3244  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 221 aa  89.4  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1578  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 203 aa  89  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5542  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 194 aa  89  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.789571  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 197 aa  89  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 198 aa  88.6  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1874  putative regulatory protein  33.84 
 
 		 198 aa  88.2  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885441  normal  0.710734 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3410  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 192 aa  88.2  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05594  transcriptional regulator  29.8 
 
 		 191 aa  88.2  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2156  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 211 aa  88.2  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000133556 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1312  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 211 aa  88.2  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000673566 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1327  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 211 aa  88.2  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128792 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3573  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 195 aa  88.2  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0355911  normal  0.084172 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0493  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0117598 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1972  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.134426  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1289  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1626  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 211 aa  87.4  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 193 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5116  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1774  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2386  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3330  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 219 aa  86.3  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0419  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 217 aa  85.9  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00785696  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 198 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0120  transcriptional regulator, TetR family  34.05 
 
 		 227 aa  85.5  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.555065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2793  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 214 aa  85.1  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3984  transcriptional regulator, TetR family protein  29.21 
 
 		 211 aa  85.5  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3494  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 210 aa  85.1  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3326  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 207 aa  85.1  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3183  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 207 aa  85.1  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2727  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 213 aa  85.1  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0989177  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2964  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 195 aa  85.1  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0240167  normal  0.157932 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3182  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 207 aa  85.1  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1186  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 206 aa  85.1  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7468  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 218 aa  85.1  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.23471  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5345  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 198 aa  85.1  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.922777  normal  0.179588 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3433  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 193 aa  84.7  9e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.389542  normal  1 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_1144  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00178929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1032  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009972  Haur_1495  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000123966  n/a   
 
 
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NC_013440  Hoch_5198  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013132  Cpin_6698  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_1072  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000136093  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_3310  transcriptional regulator, TetR family  30.58 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0639272  normal  1 
 
 
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