More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0531 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  440  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1032  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  39.88 
 
 		 212 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6285  TetR family transcriptional regulator  47.21 
 
 		 198 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6453  TetR family transcriptional regulator  47.21 
 
 		 198 aa  138  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6688  TetR family transcriptional regulator  47.21 
 
 		 198 aa  138  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 205 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  38.07 
 
 		 192 aa  135  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2789  transcriptional regulator  39.8 
 
 		 206 aa  134  8e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4420  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 201 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3947  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 201 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2762  transcriptional regulator, TetR family  40.45 
 
 		 207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.598965  normal  0.857853 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0481  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 211 aa  123  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2210  TetR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 185 aa  122  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3753  TetR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 207 aa  121  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.02252 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2606  transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 		 209 aa  121  8e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 193 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  36.87 
 
 		 198 aa  118  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3581  TetR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 185 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 206 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 194 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4302  transcriptional regulator, TetR family  31.89 
 
 		 192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985761  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2508  transcriptional regulator, TetR family  40.57 
 
 		 206 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0944  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5717  transcriptional regulator, TetR family  37.16 
 
 		 156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 213 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 213 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0534  TetR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 196 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5182  TetR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 196 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000128547  normal  0.266544 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0969  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021423 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0716  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0418191  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 193 aa  109  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 213 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 219 aa  108  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5198  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 193 aa  108  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1395  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 202 aa  108  6e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0418723  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1874  putative regulatory protein  35.45 
 
 		 198 aa  108  7.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885441  normal  0.710734 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3000  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 193 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000368141  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4925  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 193 aa  108  8.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 193 aa  108  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0900  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308807  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0145  TetR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.437687  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1626  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2156  TetR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000133556 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 196 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1289  transcriptional regulator, TetR family  33.89 
 
 		 211 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1972  transcriptional regulator, TetR family  33.89 
 
 		 211 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.134426  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1327  TetR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128792 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1312  TetR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000673566 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 204 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 197 aa  106  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4047  TetR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 205 aa  105  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.866362  normal  0.450827 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0097  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 188 aa  105  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0160  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 193 aa  105  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1491  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556415 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 193 aa  105  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3554  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 217 aa  105  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01107  predicted DNA-binding transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  105  8e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2985  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 193 aa  104  8e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000207551  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01115  hypothetical protein  33.33 
 
 		 210 aa  105  8e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2490  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  105  8e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000804693 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1617  TetR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 202 aa  104  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0133761 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2536  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 210 aa  104  9e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.018218  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2212  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 236 aa  104  9e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1234  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 236 aa  104  9e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05760  Transcriptional regulatory protein, TetR family  34.39 
 
 		 195 aa  104  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.466087  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3254  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1233  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0636137  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2015  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283926 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3984  transcriptional regulator, TetR family protein  32 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1977  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 193 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2892  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1495  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000123966  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0493  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 222 aa  101  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0117598 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 204 aa  101  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0815  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 196 aa  101  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.642279  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2260  TetR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 214 aa  101  9e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0561114  normal  0.813784 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3078  regulatory protein, TetR  32.57 
 
 		 203 aa  99.8  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.745436  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4357  regulatory protein TetR  34.55 
 
 		 201 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 222 aa  97.8  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4262  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2355  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 201 aa  97.8  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.552854 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6901  TetR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165859 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3183  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5712  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 204 aa  97.1  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3182  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5165  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 194 aa  96.7  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.707616 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3326  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1186  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0419  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 217 aa  97.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00785696  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0839  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 203 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1394  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 214 aa  96.3  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3494  TetR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3430  transcriptional regulator, TetR family  36.57 
 
 		 195 aa  96.3  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4180  transcriptional regulator, TetR family  34.03 
 
 		 204 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0804485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 198 aa  95.9  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>