More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0145 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0145  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  402  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.437687  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1032  TetR family transcriptional regulator  52.31 
 
 		 208 aa  202  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4420  TetR family transcriptional regulator  43.98 
 
 		 201 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3947  TetR family transcriptional regulator  43.98 
 
 		 201 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2789  transcriptional regulator  43.07 
 
 		 206 aa  159  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2508  transcriptional regulator, TetR family  51.98 
 
 		 206 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2762  transcriptional regulator, TetR family  40.7 
 
 		 207 aa  158  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.598965  normal  0.857853 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3753  TetR family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 207 aa  154  9e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.02252 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2210  TetR family transcriptional regulator  45.11 
 
 		 185 aa  151  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3581  TetR family transcriptional regulator  41.85 
 
 		 185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 205 aa  136  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 218 aa  122  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 216 aa  112  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  35.6 
 
 		 212 aa  111  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 192 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 193 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4571  transcriptional regulator, TetR family  35.6 
 
 		 199 aa  95.9  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 194 aa  94.4  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08040  transcriptional regulator  37.63 
 
 		 203 aa  94  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 198 aa  94.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 193 aa  94.4  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6285  TetR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 198 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6453  TetR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 198 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 222 aa  93.6  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6688  TetR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 198 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4611  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 371 aa  91.7  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1626  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 211 aa  91.3  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3535  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 191 aa  91.3  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 198 aa  90.1  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 200 aa  89.4  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0504608 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4925  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 193 aa  89.4  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05760  Transcriptional regulatory protein, TetR family  32.29 
 
 		 195 aa  89.4  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.466087  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 198 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0534  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 196 aa  87.8  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5182  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 196 aa  87.8  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000128547  normal  0.266544 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 213 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3672  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 188 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0716  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 195 aa  87  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 206 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2606  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 209 aa  86.3  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 193 aa  86.3  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2779  transcriptional regulator, TetR family  31.66 
 
 		 200 aa  85.9  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4180  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 204 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0804485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1228  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 193 aa  85.5  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 193 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_3000  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 193 aa  85.1  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000368141  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2985  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 193 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000207551  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01107  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.24 
 
 		 210 aa  84.7  8e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2212  transcriptional regulator, TetR family  30.24 
 
 		 236 aa  84.7  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  26.18 
 
 		 193 aa  84.7  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01115  hypothetical protein  30.24 
 
 		 210 aa  84.7  8e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2490  TetR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 210 aa  84.7  8e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000804693 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1234  TetR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 236 aa  84.7  8e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1620  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 205 aa  84.7  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4144  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 188 aa  84.7  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.188303  normal  0.0621662 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1491  transcriptional regulator, TetR family  30.58 
 
 		 210 aa  84.7  9e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556415 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2536  transcriptional regulator, TetR family  30.24 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.018218  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3310  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0639272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2015  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283926 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1396  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 193 aa  83.6  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4357  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1233  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 236 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0636137  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1157  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4302  transcriptional regulator, TetR family  29.24 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985761  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2156  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000133556 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3393  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3927  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.375374  normal  0.0268365 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2892  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3062  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000497782 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1326  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0115046 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1972  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.134426  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1289  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 211 aa  81.3  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1312  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 211 aa  81.3  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000673566 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1327  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 211 aa  81.3  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128792 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1901  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 201 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.665453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3984  transcriptional regulator, TetR family protein  31.4 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1179  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 198 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288888  normal  0.322158 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B1977  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 193 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3676  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.508637  decreased coverage  0.00105541 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007778  RPB_4262  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010511  M446_1348  TetR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.054525 
 
 
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NC_008577  Shewana3_1158  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009952  Dshi_1874  putative regulatory protein  32.86 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885441  normal  0.710734 
 
 
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NC_009338  Mflv_0944  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_0160  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_3046  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_8807  putative transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009052  Sbal_1248  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_3554  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009972  Haur_3137  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_0716  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0418191  n/a   
 
 
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NC_009665  Shew185_1292  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 193 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
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NC_008345  Sfri_1088  transcriptional regulator, TetR family protein  29.41 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_1617  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0133761 
 
 
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