More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1158 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1158  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 193 aa  402  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1157  TetR family transcriptional regulator  97.41 
 
 		 193 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1228  TetR family transcriptional regulator  94.3 
 
 		 193 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3393  TetR family transcriptional regulator  92.75 
 
 		 193 aa  373  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2721  TetR family transcriptional regulator  79.27 
 
 		 193 aa  313  9e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.236108  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1292  TetR family transcriptional regulator  77.08 
 
 		 193 aa  308  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1248  TetR family transcriptional regulator  76.56 
 
 		 193 aa  305  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3062  transcriptional regulator, TetR family  76.56 
 
 		 193 aa  304  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000497782 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1326  TetR family transcriptional regulator  76.56 
 
 		 193 aa  304  7e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0115046 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3643  TetR family transcriptional regulator  65.62 
 
 		 193 aa  270  1e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256948 
 
 
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NC_010506  Swoo_4056  TetR family transcriptional regulator  65.1 
 
 		 193 aa  266  8.999999999999999e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1396  TetR family transcriptional regulator  62.18 
 
 		 193 aa  253  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1229  regulatory protein, TetR  62.69 
 
 		 235 aa  244  6e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3099  TetR family transcriptional regulator  60.1 
 
 		 192 aa  232  3e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.806996 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1088  transcriptional regulator, TetR family protein  60.22 
 
 		 198 aa  228  3e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2408  TetR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 192 aa  225  3e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0238  TetR family transcriptional regulator  51.14 
 
 		 191 aa  183  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 194 aa  95.9  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2903  transcriptional regulator of TetR family protein  29.26 
 
 		 196 aa  91.3  9e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.453644  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3704  transcriptional regulator, TetR family  30.9 
 
 		 190 aa  89.7  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.21281 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 193 aa  85.9  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
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NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 192 aa  85.1  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 204 aa  84.7  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0534  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5182  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000128547  normal  0.266544 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 193 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
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NC_008345  Sfri_2816  transcriptional regulator, TetR family protein  30.39 
 
 		 188 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_0160  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0143  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
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NC_007204  Psyc_1395  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0418723  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0145  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.437687  n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_3670  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.411004  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_4302  transcriptional regulator, TetR family  23.24 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985761  normal  0.0925574 
 
 
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NC_008345  Sfri_1841  transcriptional regulator, TetR family protein  25.41 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3000  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 193 aa  77.8  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000368141  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK2985  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000207551  n/a   
 
 
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NC_009441  Fjoh_4925  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 193 aa  77.8  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
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NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal  1 
 
 
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NC_008786  Veis_1032  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B1977  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 193 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011313  VSAL_II0224  transcriptional regulator, TetR-family  25.13 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0716  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0418191  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 206 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1394  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0293  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000668888 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0969  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021423 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4420  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3947  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2606  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4357  regulatory protein TetR  27.17 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0716  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5717  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 156 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0944  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1253  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0477994 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1348  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 217 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.054525 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1626  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2789  transcriptional regulator  26.34 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3046  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2545  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1874  putative regulatory protein  25.52 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885441  normal  0.710734 
 
 
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NC_013131  Caci_5058  transcriptional regulator, TetR family  25.61 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  22.01 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_3554  transcriptional regulator, TetR family  25.67 
 
 		 217 aa  64.7  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007778  RPB_3305  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
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NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0504608 
 
 
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NC_003910  CPS_1681  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_3581  TetR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 185 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428867  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_0110  transcriptional regulator, TetR family  51.61 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011138  MADE_02226  transcriptional regulator, TetR family protein  22.99 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.972925  n/a   
 
 
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NC_010725  Mpop_4180  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0804485  normal  1 
 
 
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NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
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NC_013131  Caci_4571  transcriptional regulator, TetR family  25.54 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
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NC_011773  BCAH820_3345  transcriptional regulator, TetR family  23.16 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_005945  BAS0948  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.627177  n/a   
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B3093  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0252517 
 
 
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NC_007530  GBAA_1013  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_3410  transcriptional regulator, TetR family  21.05 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208492  normal  1 
 
 
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NC_008228  Patl_4123  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007778  RPB_4262  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 226 aa  62  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008048  Sala_2692  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 193 aa  62  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.504761 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A1181  transcriptional regulator, TetR family  25.49 
 
 		 191 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000215765  n/a   
 
 
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